ID AE000001;
FT CDS 202..1557
FT /M1_GAS_orthologue="SPy0002"
FT /MGAS10394_orthologue="M6_Spy0001"
FT /MGAS315_orthologue="dnaA"
FT /MGAS8232_orthologue="dnaA"
FT /SSI_1_orthologue="SPs0001"
FT /cds_id="subject0"
FT /cds_id="subject0"
FT /class="1.2.1"
FT /colour=2
FT /fasta_file="fasta/SP_new.tab.seq.00001.out"
FT /gene="dnaA"
FT /gene="dnaH"
FT /product="chromosomal replication initiator protein"
FT /systematic_id="SpyM50001"
FT misc_feature 535..1488
FT /colour=9
FT /domain="HMMPfam:PF00308;Bacterial dnaA
FT protein;1.7e-156;codon 112-429"
FT /id="SpyM50001"
FT /label=HMMPfam
FT /note="HMMPfam hit to PF00308, Bacterial dnaA protein,
FT score 1.7e-156"
FT misc_feature 655..678
FT /colour=8
FT /note="PS00017 ATP/GTP-binding site motif A (P-loop)."
FT misc_feature 1429..1488
FT /colour=8
FT /note="PS01008 DnaA protein signature."
SQ Sequence 1841271 BP; 564546 A; 354645 C; 356610 G; 565470 T; 0 other;
ttgttgatat tctgtttttt cttttttagt tttccacata aaaaatagtt gaaaacaata 60
gcggtgtcac cttaaaatgg cttttccaca ggttgtggag aacccaaatt aacagtgtta 120
atttattttc cacaggttgt ggaaaactag aatagtttat ggtagaatag ttctagaatt 180
atccacaaga aggaacctag tatgactgaa aatgaacaaa ttttttggaa cagggtcttg 240
gaattagctc agagtcaatt aaaacaggca acttatgaat tttttgttca tgatgcccgt 300
ctattaaagg tcgataagca tattgcaact atttacttag atcaaatgaa agaactcttt 360
tgggaaaaaa atcttaaaga tgttattctt actgctggtt ttgaagttta taacgctcaa 420
atttctgttg actatgtttt cgaagaagac ctaatgattg agcaaaatca gaccaaaatc 480
aatcaaaaac ctaagcagca agccttaaat tctttgccta ctgttacttc agatttaaac 540
tcgaaatata gttttgaaaa ctttattcaa ggagatgaaa atcgttgggc tgttgctgct 600
tcaatagcag tagctaatac tcctggaact acctataatc ctttgtttat ttggggtggc 660
cctgggcttg gaaaaaccca tttattaaat gctattggta attctgtact attagaaaat 720
ccaaatgctc gaattaaata tatcacagct gaaaacttta ttaatgagtt tgttatccat 780
attcgccttg ataccatgga tgaattgaaa gaaaaatttc gtaatttaga tttactcctt 840
attgatgata tccaatcttt agctaaaaaa acgctctctg gaacacaaga agagttcttt 900
aatactttta atgcacttca taataataac aaacaaattg tcctaacaag cgaccgtaca 960
ccagatcatc tcaatgattt agaagatcga ttagttactc gttttaaatg gggattaaca 1020
gtcaatatca cacctcctga ttttgaaaca cgagtggcta ttttgacaaa taaaattcaa 1080
gaatataact ttatttttcc tcaagatacc attgagtatt tggctggtca atttgattct 1140
aatgtcagag atttagaagg tgccttaaaa gatattagtc tggttgctaa tttcaaacaa 1200
attgacacga ttactgttga cattgctgcc gaagctattc gcgccagaaa gcaagatgga 1260
cctaaaatga cagttattcc catcgaagaa attcaagcgc aagttggaaa attttacggt 1320
gttaccgtca aagaaattaa agctactaaa cgaacacaaa atattgtttt agcaagacaa 1380
gtagctatgt ttttagcacg tgaaatgaca gataacagtc ttcctaaaat tggaaaagaa 1440
tttggtggca gagaccattc aacagtactc catgcctata ataaaatcaa aaacatgatc 1500
agccaggacg aaagccttag gatcgaaatt gaaaccataa aaaacaaaat taaataacat 1560
gtggaaaaga atatctttta tgaaatagtt atccacaagt tgtgaacaac catttagtct 1620
tggattctct cgtttattta gagttatcca ctatatacac aagacctact actactactt 1680
attattatac ttattaaata aaggagttct catgattcaa ttttcaatta atcgcacatt 1740
atttattcat gctttaaatg caactaaacg tgctattagc actaaaaatg ccattcctat 1800
tctttcatca ataaaaattg aagtcactcc tacaggagta actttaacag ggtctaacgg 1860
tcaaatatca attgaaaaca ctattcctgt aagtaatgaa aatgctggtt tgctaattac 1920
ctctccagga gctattttat tagaagctag tttttttatt aatattattt caagtttgcc 1980
agatattagt ataaatgtta aagaaattga acaacaccaa gttgttttaa ccagtggtaa 2040
atcagagatt accttaaaag gaaaagatgt tgaccagtat cctcgtctac aagaagtatc 2100
aacagaaaat cctttgattt taaaaacaaa attattgaag tctattattg ctgaaacagc 2160
ttttgcagcc agtttacaag aaagtcgtcc tattttaaca ggagttcata ttgtattaag 2220
taatcataaa gattttaaag cagtagcgac tgactctcat cgtatgagcc aacgtttaat 2280
cactttggac aatacttcag cagattttga tgtggttatt ccaagtaaat ctttgagaga 2340
attttcagca gtatttacag atgatattga gaccgttgag gtatttttct caccaagcca 2400
aatcttgttc agaagtgaac acatttcttt ttatacacgc ctcttagaag gaaattatcc 2460
cgatacagac cgtttattaa tgacagaatt tgagacggag gttgttttca atacccaatc 2520
ccttcgccac gctatggaac gtgccttctt gatttctaat gctactcaaa atggtactgt 2580
taagcttgag attactcaaa atcatatttc agctcatgtt aactcacctg aggttggtaa 2640
ggtaaacgag gatttagata ttgttagtca gtctggtagt gatttaacta tcagcttcaa 2700
tccaacttac cttattgagt ctttaaaagc tattaaaagt gaaacagtaa aaattcattt 2760
cttatcacca gttcgaccat tcaccctaac accaggcgat gaggaagaaa gttttatcca 2820
attaattaca ccagtacgaa caaactaagt aagaaaaagc tcccttttag gagttttttt 2880
gttattataa atattaacga taatataagt ggagaaaagt gaatgtatca aattggatca 2940
tttgttgaaa tgaaaaaacc tcatgcttgt gtaattaaag aaactggtaa aaaggctaat 3000
caatggaagg tactgagagt aggagctgat attaaaattc agtgtactaa ctgtcagcat 3060
gtgattatga tgagtcgtta tgattttgag cgaaaattaa aaaaagtact gcaaccatga 3120
aagtcctttt aaataaataa ttctagctat atttgcaacc aatactttcc taaaaaattg 3180
ttagtatgcc gttggaaaat tagctattct aacgttatcg aaagaagaaa ggtggctatt 3240
gacaatgacg aaagttgtag cacagttact tagtttctcg gcaaactata tcaaaatgag 3300
aataatacac caaactttga taatttaaat gaaggtgaaa gagtggcata atgataagca 3360
aatctgaaat tttcttctta ttcataccgc tttttcttct attttttggt ataataatct 3420
tgattgaaat ttgaatggag attcgctaaa tggctttaac agcaggtatt gtaggcttac 3480
caaatgttgg taaatcaacc ttatttaacg caattacaaa agcaggagca gaagctgcta 3540
attatccttt tgcgactatt gatcccaatg ttggtatggt agaggttcca gatgagcgtc 3600
tgcaaaaatt gacagaattg attacaccta aaaaaacagt tccgacaacc tttgaattta 3660
ctgatattgc aggtatcgtt aaaggtgctt ctagagggga aggtctagga aataaatttt 3720
tagctaatat tcgtgaagtc gatgctattg ttcatgtggt acgtgctttt gatgatgaaa 3780
atgtcatgcg tgaacaaggt cgtgaggatg ctttcgttga tcctatagca gatattgaca 3840
ctattaatct tgaattaatc ttagctgatt tagagtcaat caataaacgt tatgcgcgtg 3900
ttgaaaaaat ggcacgaact caaaaagata aagaatcagt agcagagttc aatgttttac 3960
aaaagattaa acctgttttg gaagatggga aatcagctag gacaattgag tttacagaag 4020
aggaagcaaa agttgttaaa ggtctctttt tattaacaac taaacctgtt ttatatgtag 4080
ctaatgtcga tgaagataaa gttgctaatc cagatggtat tgattatgtc aaacaaattc 4140
gtgactttgc agctactgaa aatgctgaag tagttgttat ctcagcgcgt gcagaagaag 4200
aaatttcaga gcttgacgat gaggataaag aagaattttt ggaagctatc ggtcttactg 4260
aatcaggcgt tgataaatta accagagcag cttatcatct cttaggcctt ggaacctatt 4320
ttacagcagg tgaaaaagag gttcgtgctt ggacgtttaa gcgtggtata aaagctccac 4380
aagctgctgg tattatccat tcagattttg aaagaggttt tattcgtgca gtaaccatgt 4440
cttatgatga tctaatgatc tacggttcag aaaaagccgt caaagaagct ggacgcttgc 4500
gtgaagaagg aaaagaatac gttgttcaag atggggacat catggaattc agatttaatg 4560
tgtaattata ttaaaacaat atcagaaggt tggaagaaca ttccagccct tttggcattt 4620
tagaaagaga aaatatggta aaaatgattg ttggtctggg aaatccaggc tctaaatatg 4680
aaaaaacaaa gcacaatatt ggttttatgg ctattgacaa tattgtcaag aaccttgacg 4740
ttacctttac agatgataaa aattttaaag cacagatagg aagtactttt attaatcatg 4800
aaaaagttta ctttgtgaaa cctactactt ttatgaataa tagcggcata gcagtaaaag 4860
cattactaac ctactataat attgacataa cagatttaat tgttatctat gatgatttag 4920
acatggaagt cagtaaatta cgtttacgta gtaagggttc agcaggagga cataatggca 4980
ttaagtcaat cattgcccac attggaactc aggaatttaa ccgaatcaaa gttggtattg 5040
gacgaccttt aaaaggtatg actgttatta gccatgtgat gggccaattc aataccgaag 5100
ataatattgc tatttcgtta actcttgaca gagttgtcaa tgctgtcaag ttttatttac 5160
aagaaaatga ttttgaaaaa acaatgcaga aatttaatgg ataatcatgg atattttaga 5220
attatttagt cagaataaga aagtccaatc ctggcactct ggattaacca ccttaggaag 5280
acaactggta atggggttat cgggttcaag taaagcattg gctatagctt ccgcttattt 5340
agatgatcaa aaaaaaatag ttgtggttac atcaactcaa aatgaggttg aaaaattagc 5400
cagcgattta tctagtttac ttgatgaaga acttgttttc caattttttg cagacgatgt 5460
ggctgcagcg gaatttatct ttgcgtcaat ggataaagct ctatcaagaa tagaaaccct 5520
gcaattttta aggaatccta aatctcaggg cgttttaatt gttagtttat caagcttaag 5580
aactttattg ccaaacccag atgtttttac aaagagtcag attcaactaa cagttggaga 5640
agattatgat agtgatactc ttactaaaca actgatgaca attggctatc agaaggtctc 5700
acaggtcatt agtccgggag aatttagccg tcgaggggat attttagata tctatgagat 5760
tacacaagaa ttgccttatc gattggaatt ttttggcgat gatattgata gtattaggca 5820
attttatcca gaaactcaaa aatcttttga acaactagaa ggtattttta ttaatccagc 5880
aagtgatctt atttttgagg ctagtgattt tcaacgtggc attgagcaat tagaaaaggc 5940
tctacaaaca gcacaagatg ataaaaaatc ttatttagaa gatgtattag ctgtttcaaa 6000
aaacggtttt aaacataagg atatccgtaa atttcaatca ttattttacg aaaaagagtg 6060
gtcattatta gattatattc ctaagggaac gccaatcttt tttgatgatt ttcaaaaact 6120
agttgataaa aatgcaagat ttgatttaga gattgctaat ctcttgacag aagatttaca 6180
gcaaggaaag gctctttcca atcttaacta ctttgcagat aattatcgag agcttaggca 6240
ctataagcca gcgaccttct tttcaaattt tcataaggga cttggaaata tcaaatttga 6300
tcagatgcat cagctaactc agtatgccat gcaggaattt tttaatcaat ttcctttgtt 6360
gattgatgag attaaacggt atcaaaaaaa tcaaacaacg gttattgtac aggtagagtc 6420
tcagtatgct tacgaacgac ttgaaaaatc ttttcaagat taccaatttc gccttccttt 6480
agtgagtgct aatcaaattg tttcacgtga atcacaaatt gtaattggag ctatctccag 6540
tggtttttat tttgctgatg aaaagttagc gttaatcaca gagcatgaaa tttatcataa 6600
aaagatcaaa cgacgcgcta gacgatctaa tattagcaat gctgagcgtt tgaaagatta 6660
caatgagtta gcagtaggtg attacgtggt tcataatgtc catggtatcg gtcgctttct 6720
tggaattgaa acgattcagg ttcagggaat ccatcgagat tacgttacta ttcaatatca 6780
aaattcagac cgtatttctc ttccaattga ccaaattggt agcttatcaa agtacgtttc 6840
tgctgatgga aaagaaccta aaattaataa actcaatgat ggtcgttttc aaaagacaaa 6900
gcaaaaggtc gctagacaag tagaagatat tgctgatgac cttctaaaat tatatgctga 6960
aagaagtcag caaaaaggat tttcattttc accagatgat gacttgcagc gcgcttttga 7020
tgatgatttt gcttttgtag aaacagaaga tcaacttagg tctataaagg aaattaaagc 7080
tgatatggag agcatgcaac ctatggatcg tcttttagta ggcgatgtag gatttggtaa 7140
gacagaagta gctatgaggg cagcctttaa agcggtgaat gatcacaaac aagtagctgt 7200
cttagttcca accacagtct tggcccagca gcattatgaa aacttcaaag cacgctttga 7260
aaattacctt gttgaggttg acgtcttaag tcgtttccgt agtaaaaaag agcaagctga 7320
aacactagaa catgtacaaa aaggtcaaat tgacattatt atcggaaccc atcgactcct 7380
atcaaaagat gtggtctttt ctgatttagg attaattgtg attgatgagg aacaacggtt 7440
tggtgttaag cataaagaaa ctttaaagga attaaaaact aaggttgacg tcttaacctt 7500
aacagctact ccgattccta gaaccttaca catgtctatg ttaggtatcc gagatttatc 7560
ggttattgag accccaccaa ccaatcgtta tcctgttcaa acctatgttt tggaaaataa 7620
tccaggtctc gttagagaag ctatcattcg tgaaatggat cgtggaggac aaatttttta 7680
cgtttacaat aaagttgaca ctattgaaaa gaaagttgca gagctacaag aattagtccc 7740
agaagcttct atcggttttg ttcatgggca aatgagtgaa attcaacttg aaaatacctt 7800
gattgacttt ataaatggtg attatgatgt ccttgtggct acaacaatca tcgaaacagg 7860
agttgacatt tctaatgtaa acactttgtt tattgagaat gctgatcata tgggattgtc 7920
aactttatat caactgaggg ggcgcgtcgg aagaagtaat cgtattgcct atgcttacct 7980
gatgtatcgt cctgataaga tcctaacaga agtctctgaa aaacgtttag aggctattaa 8040
aggctttact gaattaggtt caggcttcaa gattgctatg cgagatttgt ctatacgagg 8100
agcaggtaat attttaggag cttctcaaag tggctttatt gattcggtcg gttttgaaat 8160
gtattctcag ttattggaac aggctattgc tagcaagcaa ggaaaaacga ctgttcgcca 8220
aaaaggtaat actgaaatca atcttcagat tgatgcttat ttaccagatg attatattgc 8280
agatgagcgc caaaaaattg acatttacaa gcgtattcga gaaattcaat caagagaaga 8340
ttatctcaat ttgcaagatg agctgataga tcgttttgga gagtatcctg atcaagttgc 8400
ctatttgtta gagatagctc tgctaaaaca ttatatggac aatgcctttg cggaattagt 8460
tgaacgcaaa aataatcagg tcattgttcg atttgaagta acttctttaa gttatttctt 8520
gactcaggat tatttcgaag ccttatctaa aacccatctt aaagctaaaa ttagtgaaca 8580
tcaggggaaa atcgatatcg tctttgacgt tcgccatcaa aaagattata gaattttaga 8640
agaattgatg ttatttggag aaaggcttag tgagataaaa atcagaaaaa acaattcagt 8700
ttttaaataa taatttgaaa caacttttag actgaatagt attaatgaca atggaacgaa 8760
ctagctcttt atacttttgt caaaaatcta agatctttgc tgcgaaatta ggatcttttc 8820
taccatttaa aaaataaaaa tgataaaatg aagaggattg taggagaaat tatgagacta 8880
gataaatatc taaaggtatc gcgccttatt aaacgtcgtt cagtagcaaa agaagttgcg 8940
gataagggac gaattaaagt taatgggata cttgctaaaa gttcaacgaa tgtaaaacta 9000
aatgatcaca ttgaaattag ttttggaaat aaattactga cagtaagagt cattgaaata 9060
aaagatagta caaaaaaaga agatgctctt aagatgtatg agataatcag tgaaacaagg 9120
ataacattaa atgaagaagc ctagtattgt tcaattaaat aatcattata ttaagaaaga 9180
gaatctcaaa aaaaaatttg aagaagaaga atctcaaaaa agaaatcgtt ttatgggatg 9240
gatccttgta agtatgatgt ttttatttat tttgccaact tataatcttg tcaaaagtta 9300
tgttgatttt gaaaagcaaa atcaacaggt ggttaaatta aaaaaagagt ataatgaatt 9360
gtcaaagagt acaaaaaaag aaaaacaatt agcagaacga ctaaaagatg ataattttgt 9420
caaaaaatat gctagggcaa aatactattt atcgcgtgaa ggagaaatga tttatcctat 9480
tccaggacta ttaccaaaat gatgatggac aatattataa aaaaaataga agcatttctt 9540
gctttttctg ataaaaaatt agcagagctg caacaggaaa atcaaaaagt taaagaagaa 9600