The Perl Toolchain Summit needs more sponsors. If your company depends on Perl, please support this very important event.
#NEXUS
begin taxa;
	dimensions ntax=32;
	taxlabels
	otu_1	otu_2	otu_3	otu_4	otu_5	otu_6	otu_7	otu_8	otu_9	otu_10	otu_11	otu_12	otu_13	otu_14	otu_15	otu_16	otu_17	otu_18	otu_19	otu_20	otu_21	otu_22	otu_23	otu_24	otu_25	otu_26	otu_27	otu_28	otu_29	otu_30	otu_31	otu_32;
end;

begin characters;
	dimensions nchar=280;
	format datatype=protein missing=? gap=-;
	matrix
otu_1	?????????????????????????????????MTVYSYLVILFILLDNYCSAYGYG-----YSYYHRRHFDPAIASFTK-------EPYIGAVWFTQHGDY----MYVNGSVAGLPPGKLLGTHVHRYG--------GLGNMCLEAGPHFNPFNQ-RHGPRHG--YPRHAGDLGNIRVGRGGVAKFDFYVTIKGLGPFDGFIGRALVIHANRDDLGRN---RDEGSRTTGNSGPRLACATIGFRAP?????????????????????????????????
otu_2	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MAMKAVCVLKG------DGPVQGTIHFEQKASGE--PVVLSGQITGLTE-GQHGFHVHQYG--------DNTQGCTSAGPHFNPHSK-KHGGPAD--EERHVGDLGNVTAGKDGVANVSIEHRVISLSGEHSIIGRTMVVHEKQDDLGKG-G--NEESTKTGNAGSRLACGVIGIAQ??????????????????????????????????
otu_3	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DV--KGTVHFEQQDAKS--PVLVTGEVNGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCTSAGPHFNPYGN-SHGAPSD--LNRHLGDLGNIEASGDGATKVEISDKLITLFGENSIVGRTIVVHADPDDLGKG---GHELSKTTGNAGARLGCGVIGICKI?????????????????????????????????
otu_4	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVKAVAVVRG------DSNVKGTVIFEQESESA--PTTITYDISGNDPNAKRGFHIHTFG--------DNTNGCTSAGPHFNPHGT-THGDRTA--EVRHVGDLGNIETDAQGNAKGTVTDNLVKLIGPESVIGRTVVVHAGTDDLGKG---GNEESLKTGNAGPRPACGVIGISQ??????????????????????????????????
otu_5	????????????????????????????????????MDILSDIANAVLPQDVVSKVE-------------SKRAVAVLRG------TA-VFGTVWLTQKAEGE--ETEFEGEIKGLSP-GLHGFHIHQYG--------DSTDGCTSAGPHFNPCKM-NHGGRDS--VVRHVGDLGNVEAGADGVAKIKFSDKVVSLFGANTVIGRSMVVHVDRDDLGQGIDDKAEESLKTGNAGARAACGVIALAAPA????????????????????????????????
otu_6	????????????????????????????????????MKRFSLAILALVVATGAQAAS-----------EKVEMNLVTSQG------VGQSIGSVTITETDKG----LEFSPDLKALPP-GEHGFHIHAKGSCQPATKDGKASAAESAGGHLDPQNTGKHEGPEG---AGHLGDLPALVVNNDGKATDAVIAP--RLKSLDEIKDKALMVHVGGDNMSDQ-------PKPLGGGGERYACGVIK?????????????????????????????????????
otu_7	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVKAVAVLGS------SDGVKGTIFFTQEGDG---PTAVTGSVSGLKP-GLHGFHVHALG--------DTTNGCMSTGHDYNPASK-EHGAPED--ENRHAGDLGNVTAGADGVANINVTDSQIPLTGPNSIIGRAVVVHADPDDLGKG---GHELSKSTGNAGGRVACGIIGLQG??????????????????????????????????
otu_8	????????????????????????????????????????????????????????M-------------STNAIAVLRG------DT-VSGIIRFKQDKEGL--PTTVTGEVKGLTP-GLHGFHIHQYG--------DTTNGCISAGPHFNPYNK-THGDRTD--EIRHVGDLGNIEAGADGTAHISISDQHIQLLGPNSIIGRSIVVHADQDDLGKGVGAKKDESLKTGNAGARVACGIVAIGAAS????????????????????????????????
otu_9	???????????????????????????MINSFIVIFLSFLIFINYANLVYVEATHVYGRRSHSNGMHGNGARRAVAVLRG------DAGVSGIIYFQQDSGGS--ITTISGSVSGLTP-GLHGFHVHQYG--------DQTNGCTSAGGHYNPYGK-THGDPND--RIKHIGDLGNIVAGANGVAEVYINSYHIKLRGPLSVIGRSLVVHENPDDLGQGTGNMREESLKTGNAGSRLACAVIGIAAVS????????????????????????????????
otu_10	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVKAVAVVRG------DSKVQGTVHFEQESESA--PTTISWEIEGNDPNALRGFHIHQFG--------DNTNGCTSAGPHFNPFGK-QHGAPED--DERHVGDLGNISTDGNGVAKGTKQDLLIKLIGKDSILGRTIVVHAGTDDYGKG---GFEDSKTTGHAGARPACGVIGLTQ??????????????????????????????????
otu_11	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVKAVVVLGS------SEIVKGTIHFVQEGDG---PTTVTGSVSGLKP-GLHGFHIHALG--------DTTNGCMSTGPHYNPAGK-EHGAPED--ETRHAGDLGNVTAGEDGVANIHVVDSQIPLTGPNSIIGRAVVVHADPDDLGKG---GHELSKTTGNAGGRVACGIIGLQG??????????????????????????????????
otu_12	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVKAVAVLAS------SEGVKGTIFFSQEGDG---PTSVTGSVSGLKP-GLHGFHVHALG--------DTTNGCMSTGPHFNPTGK-EHGAPQD--ENRHAGDLGNITAGADGVANVNVSDSQIPLTGAHSIIGRAVVVHADPDDLGKG---GHELSKTTGNAGGRVACGIIGLQG??????????????????????????????????
otu_13	???????????????????????????????????????????????????????????????????????MKAVCVMTG------TAGVKGVVKFTQETDNG--PVHVHAEFSGLKA-GKHGFHVHEFG--------DTTNGCTSAGAHFNPTKQ-EHGAPED--SIRHVGDLGNVVAGADGNAVYNATDKLISLNGSHSIIGRTMVIHENEDDLGRG---GHELSKVTGNAGGRLACGVVGLAAE?????????????????????????????????
otu_14	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVKAVAVLNS------SEGVSGTIFFTQEGDG---PTTVTGNLSGLKP-GLHGFHVHALG--------DTTNGCMSTGPHFNPVGK-EHGAPED--ENRHAGDLGNVTVGDDGTAAFTIIDFQIPLTGPHSIIGRAVVVHGDPDDLGKG---GHELSKTTGNAGGRVACGIIGLQG??????????????????????????????????
otu_15	???????MAATNTILAFSSPSRLLIPPSSNPSTLRSSFRGVSLNNNNLHRLQSVSFAVKAPSKALTVVSAAKKAVAVLKG------TSDVEGVVTLTQDDSG---PTTVNVRITGLTP-GPHGFHLHEFG--------DTTNGCISTGPHFNPNNM-THGAPED--ECRHAGDLGNINANADGVAETTIVDNQIPLTGPNSVVGRAFVVHELKDDLGKG---GHELSLTTGNAGGRLACGMFKLSITMT???????????????????????????????
otu_16	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSET--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVSITDSRITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGKG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_17	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSET--PVKVSGEVCGLAK-CLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPHGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVSITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGKG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_18	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSGT--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVNITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGQG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_19	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSGT--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVNITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGQG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_20	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSET--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVSITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGKG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_21	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSET--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVSITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGQG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_22	??????????????????????????????????MFMNLLTQVSNAIFPQVEAAQKM-------------SNRAVAVLRG------ET-VTGTIWITQKSEND--QAVIEGEIKGLTP-GLHGFHVHQYG--------DSTNGCISAGPHFNPFGK-THGGPKS--EIRHVGDLGNVEAGADGVAKIKLTDTLVTLYGPNTVVGRSMVVHAGQDDLGEGVGDKAEESKKTGNAGARAACGVIALAAPQ????????????????????????????????
otu_23	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSGT--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVNITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGQG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_24	MSSIKIEFAVQMRRGDESYAGALRSALDGVGQVEIDTQEGRVIIQTQRPWSEIQDKIEATGVRAVLSGFGGQSAVALINTTGSVVDKTPIQGVVRFTTITADKKPGVVVDGVVDGLSP-GLHGLHIHESG--------DTSAGCSSVGEHYNPRQS-PHGSPAAGAEERHAGDLGNIRADENGRATFRFVDPVLEVWD---IIGRAVVLTANADDLGRG---GNDQSLIDGNSGERIACGIIARSAGILENFKRICACDGVTLWDERNKPLAGKERSQKL
otu_25	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MAKGVAVLNS------SEGVTGTIFFTQEGDG---VTTVSGTVSGLKP-GLHGFHVHALG--------DTTNGCMSTGPHFNPDGK-THGAPED--ANRHAGDLGNITVGDDGTATFTITDCQIPLTGPNSIVGRAVVVHADPDDLGKG---GHELSLATGNAGGRVACGK???????????????????????????????????????
otu_26	???????????????????????????????????MMQYLVVSLALCATICSAAQTRN-----------MPIQAIAYLIGPVQ-SDNTQVKGNVTFTQNDCGQ--NVHVRVQLEGLKE-GKHGFHIHEKG--------DLTNGCISMGAHYNPDKV-DHGGPDH--EVRHVGDLGNLEANSTGIIDVTYTDQVITLTGKLGIIGRGVVVHELEDDLGLG---NHTDSKKTGNAGGRIACGVIGIK???????????????????????????????????
otu_27	????????????????????????????????????????????????????????????????MEAPRGNLRAVALIAG------DNNVRGCLQFVQDISG---TTHVTGKISGLSP-GFHGFHIHSFG--------DTTNGCISTGPHFNPLNR-VHGPPNE--EERHAGDLGNILAGSNGVAEILIKDKHIPLSGQYSILGRAVVVHADPDDLGKG---GHKLSKSTGNAGSRVGCGIIGLQSSADAKL????????????????????????????
otu_28	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQEGEGC--PVKVTGEVTGLAK-GQHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYQK-EHGAPTD--ENRHLGDLGNIIANGDGPTPVNICDCKITLLGANSIIGRTVVVHADPDDLGKG---GHELSKTTGNAGARIGCGVIGIAKI?????????????????????????????????
otu_29	?????????????????????????????????????????????????????????????????????MVVKAVCVING------DA--KGTVFFEQESSGT--PVKVSGEVCGLAK-GLHGFHVHEFG--------DNTNGCMSSGPHFNPYGK-EHGAPVD--ENRHLGDLGNIEATGDCPTKVNITDSKITLFGADSIIGRTVVVHADADDLGQG---GHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV?????????????????????????????????
otu_30	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVQAVAVLKG------DAGVSGVVKFEQASESE--PTTVSYEIAGNSPNAERGFHIHEFG--------DATNGCVSAGPHFNPFKK-THGAPTD--EVRHVGDMGNVKTDENGVAKGSFKDSLIKLIGPTSVVGRSVVIHAGQDDLGKG---DTEESLKTGNAGPRPACGVIGLTN??????????????????????????????????
otu_31	??????????????????????????????????????????????????????????????????????MVRAVAVLRG------DSKVSGVVTFEQVDQNS--QVSVIVDLVGNDANAKRGFHIHQFG--------DNTNGCTSAGPHFNPEGK-THGDRTA--AVRHVGDLGNLESDAQGNIKTTFSDSVISLFGANSIIGRTIVIHAGEDDLGKG---TSEESLKTGNAGARNACGVIGIAV??????????????????????????????????
otu_32	????????????????????????????????????MKTRVVLILALSVCIEAAS--------------EVIRARAYIFKAEAGKIPTELIGTIDFDQ--SGS--FLKLNGSVSGLAA-GKHGFHIHEKG--------DTGNGCLSAGGHYNPHKL-SHGAPDD--SNRHIGDLGNIESPASGDTLISVSDSLASLSGQYSIIGRSVVIHEKTDDLGRG---TSDQSKTTGNAGSRLACGTIGTV???????????????????????????????????
;
end;

begin trees;
	tree Cu_Zn_superoxide_dismutase = ((otu_24:0.9929,(((otu_26:0.68297,otu_32:0.55754)30:0.14493[0.82],otu_13:0.29491)29:0.06243[0.44],(((((otu_9:0.31741,otu_8:0.13498)27:0.20268[1],(otu_22:0.14579,otu_5:0.27311)28:0.2533[1])26:0.12655[0.98],((otu_30:0.28255,otu_10:0.25631)25:0.08358[0.91],(otu_31:0.3159,otu_4:0.1635)24:0.11954[0.97])23:0.17514[1])22:0.08988[0.77],(otu_2:0.49149,(otu_3:0.18945,(otu_28:0.11453,(((otu_17:0.00661,otu_16:0.00769)17:0.00497[0.92],(otu_21:0.004,otu_20:0.01012)18:0.0073[0.87])16:0.01271[0.88],(((otu_23:0.00836,otu_19:0.00552)21:0.00203[0.28],otu_18:0.01103)20:0.00398[0.7],otu_29:0.00595)19:0.00739[0.75])15:0.11795[1])14:0.11754[1])13:0.12932[1])12:0.10326[1])11:0.0712[0.9],(((((otu_7:0.05142,otu_11:0.09031)10:0.02799[0.98],otu_12:0.06915)9:0.05245[0.99],(otu_25:0.17064,otu_14:0.1075)8:0.08023[1])7:0.08596[1],otu_27:0.46052)6:0.06401[0.75],otu_15:0.42442)5:0.14252[0.94])4:0.15394[0.91])3:0.16508[0.85])2:0.16387[0.45],otu_1:1.03491,otu_6:1.06056)1;
end;