FASTXY compares a DNA sequence to a protein sequence data bank
version 3.4t07 Nov 21, 2001
Please cite:
Pearson et al, Genomics (1997) 46:24-36
5X_1895.fa, 7972 aa
vs /home/jason/genomes/S_cerevisea/pep/yeast_nrpep.fasta library
opt E()
< 20 53 0:====
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4215311 residues in 9190 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0381+/-0.00065; mu= 23.8752+/- 0.039
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Lambda= 0.1711
Kolmogorov-Smirnov statistic: 0.0414 (N=29) at 52
FASTY (3.42 Sept 2001) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are: opt bits E(9190)
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.: .. :::: ::: :::: ::::::: :::...:::
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:..::.:::: :.. .:::.:::.: ::::.:.:: .:::.::.::::::::::::::
NR_SC: TREVNEMDPFESFISNQNIRYVYYKESEKILGNTYGMCILQDFEALTPNLLARTIETVEG
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:::::.:::.::::::::.:.: : ::.::::.:: : :
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:::::::::::::.:::.:::::::::: .:... :.:. :. ::.:.::.:
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190 200 210 220 230 240
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: :. .:::..:.:::.::.:::.:..:::::.:. :::::::::::::::::..:.::.
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5X_189 AHDYSNIFVTSPDPENLKTLFEFVFKALDALGYEEHIDYDVVQSTNPDFKKAIVRVNIFR
.: :::::::::.::::::::::.::..:::::.::::::..:::::::.::::::.: :
NR_SC: SHGYSNIFVTSPSPENLKTLFEFIFKGFDALGYQEHIDYDIIQSTNPDFNKAIVRVDIKR
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:::::::: :.: .::::::::.::::::::::.:..:.::::::::::::::::::::
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::.:::::::.:. : .....:..: .. . . ..: :.::::.:::::::
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.::: .:::::.:::::.:.... . .: ::::.:.:. :::::::::::.:: ::..
NR_SC: APGDPIEKWLNKLLCLDVTLIKNPRFATRGTPHPSQCNLFVVNRDTLFSYHPVSENFLEK
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::::::.:::::::::::..::::::.::::::::: .: . .:::: :.:.::::.::.
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:.. . ... :.:..::.:::.:: ::::..::.:::::.:::::.:.:: :::::::.:
NR_SC: ESVRNSLSR-GQRAGGDLIPWLISQQFQDEEFASLSGARIVRIATNPEYASMGYGSRAIE
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:.....: .::.: : : .: . .:.: . .... :: .:
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. .:: . .:::: .:::. :. : :::::.:::..: .:::...:.:.: : : ::
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::.: :::.:: : ..:: ::. :::.::..::::.
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:.:: : :::..::. .. : : :: :.:.....:::.:::.::....::
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:::. :..: .: :.:: .. : : .:.:::::.::::::.... .::.. :.::.:
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.:.:..:::.. .... . :: :: : . :. .. : ::.: .:.:: .
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.. .: .: ...:.::.:.::....:: :.. .:.:..:..: :..:: . :..
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. ..: .: :.. .: :. :: ..
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>>NR_SC:SW-MPCP_YEAST SW:MPCP_YEAST P23641 saccharomyces (311 aa)
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.::::::.::. ::....:.::::::::::: :::
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::::.::.:::: ::::::::::::: .::.::::::::: :
NR_SC: KGMVGSFKQIIAGEGAGALLTGFGPTLLGYSIQGAFKFGG-------------------Y
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5X_18- EFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFANGLS
: .:: :: .: : : . ....:.:..:.:::.:::::::::::::::::::.:::::
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100 110 120 130 140 150
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5X_18- GGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFAV*VDRTA*\YQTFG*YYRSYEVAVE
::: :::.::: ..::.:: ::::::.::..::: : . : :.
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:..:.. . : ::: ::: ::::::..::::::::::.:::: ::::::..
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210 220 230 240 250
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5X_18- RLVQMAGQLGVSGLFTGMTTRLVMIGTLTAGQ
:.:.: ::: : :.:. :::::.::::. :
NR_SC: LLAQLAKQLGFFGSFAGLPTRLVMVGTLTSLQ
260 270 280
>>NR_SC:SW-YEO3_YEAST SW:YEO3_YEAST P40035 saccharomyces (300 aa)
rev-comp initn: 412 init1: 136 opt: 154 Z-score: 192.8 bits: 48.5 E(): 5.7e-05
Smith-Waterman score: 469; 33.043% identity (41.455% ungapped) in 345 aa overlap (7943-6915:18-294)
7920 7890 7860 7830 7800
5X_18- YAD/CALAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVY\TGLVVFSTVPKDFENCKAWC*C
:: :.:.: ..:. ::...::.:.:: :.:..:..: :.
NR_SC: YAT-CTLGGIIACGPTHSSITPLDLVKCRLQVNPKLY-TS--------------------
20 30 40 50
7770 7740 7710 7680 7650 7620
5X_18- HKQ*GMVASFRQIIAKEGAGALLTGFGPTAVGYAIQGAFKFGG*VMMSLQITA*SRANLP
. .::.:::.:: . :::: : :::..::: :.:: ...
NR_SC: -----NLQGFRKIIANEGWKKVYTGFGATFVGYSLQGAGKYGGYEYFKHL----------
60 70 80 90 100
7590 7560 7530 7500 7470 7440
5X_18- ISYEFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIR-LVSQPSFA
: : . .. ..:: ::: :::.::: :::.:: ... ...: :
NR_SC: --YSSWLSPGV-------------TVYLMASATAEFLADIMLCPFEAIKVKQQTTMPPFC
110 120 130 140
7410 7380 7350 7320 7290 7260
5X_18- NGLSGGFLRILREEGP-AAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFAV*VDRTA**SNIWLILS\SY
:.. :. .. : : ::: :. :. .:.:::: :: . :.
NR_SC: NNVVDGWKKMYAESGGMKAFYKGIVPLWCRQIPYTMCKF-----------------T-SF
150 160 170 180
7230 7200 7170 7140 7110 7080
5X_18- EVAVEKILKATGKSKDSLTGGQLTGLNLTSGLIAGLAAAVISQPADTLLSKINKTKGAPG
: :.:: .. :.:. ... : ......: .::. :..:.:::...::::. . : .
NR_SC: EKIVQKIYSVLPKKKEEMNALQQISVSFVGGYLAGILCAAVSHPADVMVSKINSERKA-N
190 200 210 220 230 240
7050 7020 6990 6960 6930
5X_18- QSTTSRLVQMAGQLGVSGLFTGMTTRLVMIGTLTAGQ/W*VSNAFDAGV
.: . .. ..: .::..:. .:.:::::::. : : . ..: : :
NR_SC: ESMSVASKRIYQKIGFTGLWNGLMVRIVMIGTLTSFQ-WLIYDSFKAYV
250 260 270 280 290
>>NR_SC:SW-RIM2_YEAST SW:RIM2_YEAST P38127 saccharomyces (377 aa)
rev-comp initn: 79 init1: 79 opt: 134 Z-score: 164.9 bits: 43.6 E(): 0.002
Smith-Waterman score: 145; 26.047% identity (30.769% ungapped) in 215 aa overlap (7929-7299:180-366)
7930 7900 7870 7840 7810 7780
5X_18- LAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVYNRVGRFFNSS*GF\WNCKAWC*CHKQ*GM
.:.: . .: : .:. ..:::.::. . : .. :: :.:
NR_SC: MAAATAGWATATATNPIWLIKTRVQLDKAGKTSVRQYKNS-----WDC------------
180 190 200 210 220
7750 7720 7690 7660 7630 7600
5X_18- VASFRQIIAKEGAGALLTGFGPTAVGYAIQGAFKFGG*VMMSLQITA*SRANLPISYEFW
....: .:: .: :.. . .: ...: ... .:. : : .. . :
NR_SC: ---LKSVIRNEGFTGLYKGLSASYLG-SVEGILQWLLYEQMKRLIKERSIEKFGYQAEGT
230 240 250 260 270
7570 7540 7510 7480 7450 7420
5X_18- KKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFA-----NG
:. . .:..: : :....:.: :.:: : :..: :: . :. .:
NR_SC: KSTS------EKVKEWCQ--RSGSAGLAKFVASIATYPHEVVRTRLRQTPKENGKRKYTG
280 290 300 310 320 330
7390 7360 7330
5X_18- LSGGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKF
: .: :..::: ..:.:. : :.. :: .. :
NR_SC: LVQSFKVIIKEEGLFSMYSGLTPHLMRTVPNSIIMF
340 350 360
>>NR_SC:SW-Q05330 SW:Q05330 Q05330 saccharomyces cerevis (302 aa)
initn: 76 init1: 76 opt: 122 Z-score: 150.1 bits: 40.6 E(): 0.014
Smith-Waterman score: 123; 24.713% identity (28.667% ungapped) in 174 aa overlap (896-1372:55-219)
920 950 980 1010 1040 1070
5X_189 RTHRKRYQRHFHPHHRRHHL*THHRSHLDRNR*RRPLAANLQRLVPVCDRPQPIPNNH*C
:::..... : : :. :.: :::.:: ..: .. :: . .: . : . :
NR_SC: RTHQHHHRTHQHHHRTRQH---HHRTHLHHHRIHQRHHHIRQRHHHIRQRRHRILQRHHR
60 70 80 90 100 110
1100 1130 1160 1190
5X_189 QRHEKSKEGRRNENTPLRLL--------------TA*PRQGPSSL*FHPVVV-HSALVPH
:... : . : :::: .. :. .. ..:. :...: :
NR_SC: IRQRRLPTLPRRQATALRLLLILLHLHHTLLRHQVTAQRHQVTAQRLQPIPQHHQVIVLH
120 130 140 150 160 170
1220 1250 1280 1310 1340 1370
5X_189 R*QTHLCPARLLQEHQAWQHSSLGLAPAEGMGTYRPIGNLKDQRGVKKLRALIQ
: .: : ..: :: : : : . .. . . . : .. : ..:
NR_SC: RLHT------LQHHHPIPQHHLLTLPPLQTIALLHLLTPQHLQATAQDLLHILQ
180 190 200 210
>>NR_SC:SW-AMYH_YEAST SW:AMYH_YEAST P08640 saccharomyces (1367 aa)
initn: 142 init1: 95 opt: 128 Z-score: 150.0 bits: 42.7 E(): 0.014
Smith-Waterman score: 152; 26.792% identity (28.629% ungapped) in 265 aa overlap (3295-4068:302-556)
3310 3340 3370 3400 3430 3460
5X_189 TSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTSSEVTDKPSNTSPPKILT
::: : ..: : : :. : .: .:: . . :.:. ::.. ...: . :
NR_SC: TSKTC---TKKTTTPVPTPSSSTTESSSAPVPTPSSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPT
310 320 330 340 350
3490 3520 3550 3580 3610 3640
5X_189 FSAKLSLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISCLWPPPSTVTRVLAVHCPSSSFSNSVNR/PR
:.. . :: . : .::::.. .: . : :::: ..: . :
NR_SC: PSSSTTESSSAPVTSSTTE---SSSAPVTS----STTESSSAPVPTPSSSTTESSSA-PV
360 370 380 390 400 410
3670 3700 3730 3760 3790 3820
5X_189 PSITKDSENAAASSAGSSSKAAA\VVDRALVSCDLFVRSSLMSLSVTPPETMLKSG*TTS
: : .: .: ..:. . :..: :.. . : . : :: : .: : .: . .:
NR_SC: TSSTTESSSAPVTSSTTESSSAP-VTSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPTPSSSTTESS
420 430 440 450 460
3850 3880 3910 3940 3970
5X_189 SASMPPSSPNLSKVALTLPNASFT------MSTATLSSLITPLQKCSCKG*WRSTS-LPT
:: . :. . :.. . :..: : ....: : .:. : . . :.. ::
NR_SC: SAPVTSSTTESSSAPVPTPSSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPTPSSSTTESSSAPAPT
470 480 490 500 510 520
4000 4030 4060
5X_189 TRTLLTTCRCFPMLPLIIFSFSSPLST
. : :. : :.:. :
NR_SC: PSSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPT
530 540 550
>>NR_SC:SW-PET8_YEAST SW:PET8_YEAST P38921 saccharomyces (284 aa)
rev-comp initn: 91 init1: 91 opt: 121 Z-score: 149.1 bits: 40.3 E(): 0.016
Smith-Waterman score: 121; 34.146% identity (35.897% ungapped) in 82 aa overlap (7583-7338:172-249)
7560 7530 7500 7470 7440 7410
5X_18- YEFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFANGL
::. :: : .... . :: ..:: .: . ::. . ::. . . :. :
NR_SC: YEYLKKTWAKANGQSQVEPWKGAI---CGSIAGGIAAATTTPLDFLKTRLMLNKTTAS-L
180 190 200 210 220
7380 7350
5X_18- SGGFLRILREEGPAAFYAGFGP
.. ..:: ::::::.:..: ::
NR_SC: GSVIIRIYREEGPAVFFSGVGP
230 240
>>NR_SC:SW-AGA1_YEAST SW:AGA1_YEAST P32323 saccharomyces (725 aa)
initn: 156 init1: 88 opt: 124 Z-score: 148.1 bits: 41.4 E(): 0.018
Smith-Waterman score: 144; 23.699% identity (26.032% ungapped) in 346 aa overlap (3286-4232:176-520)
3310 3340 3370 3400 3430 3460
5X_189 TPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTSSEVTDKPSNTSPPK
: ... .::: : : .. : .... ... ....:: .. .::.:: .
NR_SC: TTSSNPTTTSLSSTSTSPSSTSTSPSSTSTSSSSTSTSSSSTSTSSSSTSTSPSSTSTSS
180 190 200 210 220 230
3490 3520 3550 3580 3610 3640
5X_189 ILTFSAKLSLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISCLWPPPSTVTRVLAVHCPSSSFSN/YRE
:: ... : :. .. . .: . : :: .. :.: :. :
NR_SC: SLTSTSSSSTSTSQSSTSTSSSSTSTSPSSTSTSSSSTSTSPSSKSTSASSTSTSS-YST
240 250 260 270 280 290
3670 3700 3730 3760 3790
5X_189 QTRPSITKDSENAAASSAGSSSKAAAAGRSGAGL\GDLFVRSSLMSLSVTPPETMLKSG*
.: ::.:..: . :..: .:.: ... : ..: :. .. :: :.:. : : . :
NR_SC: STSPSLTSSSPTLASTSPSSTSISSTFTDSTSSL-GSSIASSST-SVSLYSPSTPVYSVP
300 310 320 330 340 350
3820 3850 3880 3910 3940
5X_189 TTSSASMPP---------------SSPNLSKVALTLPNASFTMSTA-TLSSLITPLQKCS
.::: : :: ..: ... ::.::: : : .: .
NR_SC: STSSNVATPSMTSSTVETTVSSQSSSEYITKSSISTTIPSFSMSTYFTTVSGVTTMYTTW
360 370 380 390 400 410
3970 4000 4030 4060 4090
5X_189 CKG*WRS---------TSLPTTRTLLTTCRCFPMLPLIIFSFSSPLSTRMIIPSL---TL
: .: .. : :. : :.: ... : .::. . :. :.
NR_SC: CPYSSESETSTLTSMHETVTTDATVCTHESCMPSQTTSLITSSIKMSTKNVATSVSTSTV
420 430 440 450 460 470
4120 4150 4180 4210
5X_189 LSSFK/CAL--EGNISREAILKEMAQSGMRSSGDMIPWIISTQFQDNDF
::. :. : . : .. ..: ... . :. : .:.::
NR_SC: ESSYA-CSTCAETSHSYSSVQTASSSSVTQQTTSTKSWVSSMTTSDEDF
480 490 500 510 520
>>NR_SC:SW-PMT_YEAST SW:PMT_YEAST P32332 saccharomyces c (324 aa)
rev-comp initn: 86 init1: 86 opt: 120 Z-score: 147.1 bits: 40.1 E(): 0.02
Smith-Waterman score: 120; 29.630% identity (29.630% ungapped) in 81 aa overlap (7162-6920:231-311)
7160 7130 7100 7070 7040 7010
5X_18- LNLTSGLIAGLAAAVISQPADTLLSKINKTKGAPGQSTTSRLVQMAGQLGVSGLFTGMTT
:.::.. :.::..::. .: :..:..: . :: .. . ::. . ::..:. :...
NR_SC: LHLTASTISGLGVAVVMNPWDVILTRIYNQKGDLYKGPIDCLVKTVRIEGVTALYKGFAA
240 250 260 270 280 290
6980 6950
5X_18- RLVMIGTLTAGQCKFQMRLMQ
.. :. : :. . :.
NR_SC: QVFRIAPHTIMCLTFMEQTMK
300 310
>>NR_SC:GP-CAA81388_1 gi|439289|emb|CAA81388.1 (Z26645) (751 aa)
rev-comp initn: 83 init1: 83 opt: 115 Z-score: 135.9 bits: 39.2 E(): 0.085
Smith-Waterman score: 139; 26.996% identity (29.218% ungapped) in 263 aa overlap (7747-6985:222-472)
7730 7700 7670 7640 7610
5X_18- PLSDKSLPRRVPVLFSLVSAPPPSVTPSRVPSSSVGK**CLFK*PPRAALTCQ----LVT
:: . ::: .: . .:::: ::. .:. : . :: . . :.
NR_SC: PLPSASLPTHVS---NPPQAPPPPPTPTIGLDSKNIKPTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAE
230 240 250 260 270
7580 7550 7520 7490 7460 7430
5X_18- SFGRR--RPLTSLVSTRPVRTDRPSTLVPLPSPSSSPTLLSVPLRPLESGLS/PQPS\LP
.:: : . ::. ..:. .. : :::.: . . :: : :: ::
NR_SC: INARRSERGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQRPLPSSAPPIPTSHAPPLPPTAP-PPPS-LP
280 290 300 310 320 330
7400 7370 7340 7310 7280 7250
5X_18- TVFPVVSLGF*GRKVPLPSTPVSALSSSSRFLIPWPSSPCKSTVL/P**SNIW/PNTIAA
.: . . . . . : : :.. :.:. . : : . : : .... :: ..
NR_SC: NVTSAPKKATSAPRPPPPPLPAAMSSASTNSVKATPVPPTLAPPL-PNTTSVP-PNKASS
340 350 360 370 380 390
7220 7190 7160 7130 7100 7070
5X_18- TRSPSRRSSRPLASPRTLLLVDSSLVLTLLPVLSPVWPPPLSLNPPTPSCLRSTRPRAPP
.: : : . ..:.: . .: :.:. ::: ::. . . : ::
NR_SC: MPAPPP----PPPPPPGAFSTSSALSASSIP-LAPLPPPP----PPSVATSVPSAPPPPP
400 410 420 430 440
7040 7010
5X_18- --ASLPPLGSSRWLVSSVFPVSSPV*P
.. : .::. : :: :.:
NR_SC: TLTTNKPSASSKQSKISSSSSSSAVTP
450 460 470
>>NR_SC:SW-Q07229 SW:Q07229 Q07229 saccharomyces cerevis (817 aa)
rev-comp initn: 83 init1: 83 opt: 115 Z-score: 135.4 bits: 39.3 E(): 0.09
Smith-Waterman score: 134; 26.996% identity (29.218% ungapped) in 263 aa overlap (7747-6985:222-472)
7730 7700 7670 7640 7610
5X_18- PLSDKSLPRRVPVLFSLVSAPPPSVTPSRVPSSSVGK**CLFK*PPRAALTCQ----LVT
:: . ::: .: . .:::: ::. .:. : . :: . . :.
NR_SC: PLPSASLPTHVS---NPPQAPPPPPTPTIGLDSKNIKPTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAE
230 240 250 260 270
7580 7550 7520 7490 7460 7430
5X_18- SFGRR--RPLTSLVSTRPVRTDRPSTLVPLPSPSSSPTLLSVPLRPLESGLS/PQPS\LP
.:: : . ::. ..:. .. : :::.: . . :: : :: ::
NR_SC: INARRSERGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQPPLPSSAPPIPTSHAPPLPPTAP-PPPS-LP
280 290 300 310 320 330
7400 7370 7340 7310 7280 7250
5X_18- TVFPVVSLGF*GRKVPLPSTPVSALSSSSRFLIPWPSSPCKSTVL/P**SNIW/PNTIAA
.: . . . . : : :.. :.:. . : : . : : .... :: ..
NR_SC: NVTSAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKATPVPPTLAPPL-PNTTSVP-PNKASS
340 350 360 370 380 390
7220 7190 7160 7130 7100 7070
5X_18- TRSPSRRSSRPLASPRTLLLVDSSLVLTLLPVLSPVWPPPLSLNPPTPSCLRSTRPRAPP
.: : : . ..:.: . .: :.:. ::: ::. . . : ::
NR_SC: MPAPPP----PPPPPPGAFSTSSALSASSIP-LAPLPPPP----PPSVATSVPSAPPPPP
400 410 420 430 440
7040 7010
5X_18- --ASLPPLGSSRWLVSSVFPVSSPV*P
.. : .::. : :: :.:
NR_SC: TLTTNKPSASSKQSKISSSSSSSAVTP
450 460 470
>>NR_SC:SW-VRP1_YEAST SW:VRP1_YEAST P37370 saccharomyces (817 aa)
rev-comp initn: 83 init1: 83 opt: 115 Z-score: 135.4 bits: 39.3 E(): 0.09
Smith-Waterman score: 134; 26.996% identity (29.218% ungapped) in 263 aa overlap (7747-6985:222-472)
7730 7700 7670 7640 7610
5X_18- PLSDKSLPRRVPVLFSLVSAPPPSVTPSRVPSSSVGK**CLFK*PPRAALTCQ----LVT
:: . ::: .: . .:::: ::. .:. : . :: . . :.
NR_SC: PLPSASLPTHVS---NPPQAPPPPPTPTIGLDSKNIKPTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAE
230 240 250 260 270
7580 7550 7520 7490 7460 7430
5X_18- SFGRR--RPLTSLVSTRPVRTDRPSTLVPLPSPSSSPTLLSVPLRPLESGLS/PQPS\LP
.:: : . ::. ..:. .. : :::.: . . :: : :: ::
NR_SC: INARRSERGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQPPLPSSAPPIPTSHAPPLPPTAP-PPPS-LP
280 290 300 310 320 330
7400 7370 7340 7310 7280 7250
5X_18- TVFPVVSLGF*GRKVPLPSTPVSALSSSSRFLIPWPSSPCKSTVL/P**SNIW/PNTIAA
.: . . . . : : :.. :.:. . : : . : : .... :: ..
NR_SC: NVTSAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKATPVPPTLAPPL-PNTTSVP-PNKASS
340 350 360 370 380 390
7220 7190 7160 7130 7100 7070
5X_18- TRSPSRRSSRPLASPRTLLLVDSSLVLTLLPVLSPVWPPPLSLNPPTPSCLRSTRPRAPP
.: : : . ..:.: . .: :.:. ::: ::. . . : ::
NR_SC: MPAPPP----PPPPPPGAFSTSSALSASSIP-LAPLPPPP----PPSVATSVPSAPPPPP
400 410 420 430 440
7040 7010
5X_18- --ASLPPLGSSRWLVSSVFPVSSPV*P
.. : .::. : :: :.:
NR_SC: TLTTNKPSASSKQSKISSSSSSSAVTP
450 460 470
>>NR_SC:SW-Q12215 SW:Q12215 Q12215 saccharomyces cerevis (556 aa)
initn: 89 init1: 89 opt: 112 Z-score: 133.5 bits: 38.4 E(): 0.12
Smith-Waterman score: 115; 27.381% identity (29.677% ungapped) in 168 aa overlap (789-1284:154-311)
810 840 870 900 930 960
5X_189 PSSTCSLLFGPISTKTRDQHM*LATEGNDETAT\TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSS
::.: :: . ::. :: . . .. :: :.: :. : :.. :.. .:: .::
NR_SC: PSTTSSLSSAQISSTTRRTSTDMKS--SEMIAT-TVSTTSTTSSSTSSTTSSTTSSTTSS
160 170 180 190 200 210
990 1020 1050 1080 1110 1140
5X_189 SESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRIT
. :: . : ::: :. .. .. . ::. . .. ..: .. .. . .:
NR_SC: TTSSTTSSSTSSTTSSTTSSTTSSTTSSTTSSTTSSTTS--------STTSSTTSIFSVT
220 230 240 250 260
1170 1200 1230 1260
5X_189 SSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVP---SAPTPGAPGMAALEPWT
::.: .:: : . . : .. .:: :. : ..: .... : :
NR_SC: SSSSSITLSSSEHTTVDSRTSSPSSTLVPVSSSSSTLSTPKVTSMTPST
270 280 290 300 310
>>NR_SC:SW-YH17_YEAST SW:YH17_YEAST P38898 saccharomyces (153 aa)
rev-comp initn: 71 init1: 71 opt: 106 Z-score: 132.4 bits: 36.3 E(): 0.13
Smith-Waterman score: 106; 26.897% identity (28.889% ungapped) in 145 aa overlap (5788-5367:6-144)
5780 5750 5720 5690 5660 5630
5X_18- CIPFRTMQESYILLNQI*VKE*EP*SQI*I*NQKHPLTPSLPSSFHPSPLHSLSSSSSHP
:. .:: : : : . . .: . .. :: ::. :: : .. . :
NR_SC: CLTPSSMQYSDIY---IHTPHPHPHPHPHTPTHTHPHTPTPTPHPHPHTPHPHTTPTPTP
10 20 30 40 50 60
5600 5570 5540 5510 5480 5450
5X_18- WH---PHPCPSPPSLCH/PSSLSTFTLTVLDSLAPPLPDASLSTCFSASVQSPP*SIANS
: :: : :: :: : :..: . ::: . .:. :: :. .
NR_SC: HHTHTPHTTLSNLSLNL-PSHYPTSPLVTLPHSTIPLPT---TIHLSTYYYHPPPIITVT
70 80 90 100 110
5420 5390
5X_18- SMLRVFNSSLCS-FFDASSSSPFSCT
.: . ::. . .. : ::
NR_SC: LQLPISNSTTITLLLPYHPPCPTHCT
120 130 140
>>NR_SC:GP-CAB58511_1 gi|6064291|emb|CAB58511.1 (A74265) (894 aa)
initn: 70 init1: 70 opt: 113 Z-score: 132.3 bits: 38.8 E(): 0.13
Smith-Waterman score: 113; 27.820% identity (28.244% ungapped) in 133 aa overlap (892-1290:514-644)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SL
.: . : .. :: : :. .::: :. ::: ::: :: .. . :.. : :
NR_SC: ISSSTTTSTSIFSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSS
520 530 540 550 560 570
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 MSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPG
:.. . :: . .: . :::. : .:: .. : . :. :
NR_SC: SLPLVTSATTSQETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESIS-PAIVSTATVT
580 590 600 610 620 630
1270
5X_189 APGMAALEPWTCP
. :... ::
NR_SC: VSGVTTEYTTWCP
640
>>NR_SC:SW-YN23_YEAST SW:YN23_YEAST P53832 saccharomyces (503 aa)
initn: 117 init1: 72 opt: 110 Z-score: 131.4 bits: 37.8 E(): 0.15
Smith-Waterman score: 110; 29.752% identity (30.252% ungapped) in 121 aa overlap (895-1256:165-283)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
: ...: ::. ::: .:: .::: :: : . :.: :. .. .:. ::.. . .:
NR_SC: SSSSSTTSTTTSSSETTTSSSSSSSSSSTSTTSTTSTTSSTTSTSSS--PSTTSSSTSAS
170 180 190 200 210 220
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 SAS*/TRAKRAAEMRTHRSAS*PHNLVRVHLHSSFTLLLSTRHLYPTVDKPICAQRAYSR
:.: : . .:. : ..: . . . :: .. ::.. .: . . .: .
NR_SC: SSSE-TSSTQATSSSTTSTSSSTSTATVTSTPSSTSIGTSTHYTTRVVTQSVVSQANQQA
230 240 250 260 270 280
5X_189 ST
::
NR_SC: ST
>>NR_SC:SW-YHC8_YEAST SW:YHC8_YEAST P38739 saccharomyces (605 aa)
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Smith-Waterman score: 110; 29.545% identity (29.545% ungapped) in 88 aa overlap (4832-5095:216-303)
4850 4880 4910 4940 4970 5000
5X_189 S*TFSHMRHSKSLTLLSLSPSSNLPSLATLPPPHPNFSPTPSSLRSSLRLTSNVLNRTPT
. . : . : ::.: : ::. : : : . : :: .: :: . . .::
NR_SC: TSSTSTTTSTTSSTLISTSTSSSSSSTPTTTSSAPISTSTTSSTSTSTSTTSPTSSSAPT
220 230 240 250 260 270
5030 5060 5090
5X_189 ACSTITSSSTLFLPSLPYSSARGLKPAY
. :. : .:: : . : .. . .:
NR_SC: SSSNTTPTSTTFTTTSPSTAPSSTTVTY
280 290 300
>>NR_SC:SW-FLO1_YEAST SW:FLO1_YEAST P32768 saccharomyces (1537 aa)
initn: 70 init1: 70 opt: 113 Z-score: 129.4 bits: 39.1 E(): 0.2
Smith-Waterman score: 113; 27.820% identity (28.244% ungapped) in 133 aa overlap (892-1290:1144-1274)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SL
.: . : .. :: : :. .::: :. ::: ::: :: .. . :.. : :
NR_SC: ISSSTTTSTSIFSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 MSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPG
:.. . :: . .: . :::. : .:: .. : . :. :
NR_SC: SLPLVTSATTSQETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESIS-PAIVSTATVT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
5X_189 APGMAALEPWTCP
. :... ::
NR_SC: VSGVTTEYTTWCP
1270
>>NR_SC:PIR-S53465 PIR:S53465 flocculation protein FLO1 (1537 aa)
initn: 70 init1: 70 opt: 113 Z-score: 129.4 bits: 39.1 E(): 0.2
Smith-Waterman score: 113; 27.820% identity (28.244% ungapped) in 133 aa overlap (892-1290:1144-1274)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SL
.: . : .. :: : :. .::: :. ::: ::: :: .. . :.. : :
NR_SC: ISSSTTTSTSIFSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 MSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPG
:.. . :: . .: . :::. : .:: .. : . :. :
NR_SC: SLPLVTSATTSQETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESIS-PAIVSTATVT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
5X_189 APGMAALEPWTCP
. :... ::
NR_SC: VSGVTTEYTTWCP
1270
>>NR_SC:SW-Q06143 SW:Q06143 Q06143 saccharomyces cerevis (298 aa)
rev-comp initn: 153 init1: 102 opt: 105 Z-score: 127.5 bits: 36.4 E(): 0.25
Smith-Waterman score: 105; 30.986% identity (30.986% ungapped) in 71 aa overlap (7509-7299:16-86)
7510 7480 7450 7420 7390 7360
5X_18- PW/W/HSAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFANGLSGGFLRILREEGPAAFYAGFGP
:: : ... : .:: .. ::. ...:: . : : . :: .:: ...:.:..
NR_SC: PW-W-YGGAAGIFATMVTHPLDLAKVRLQAAPMPKPTLFRMLESILANEGVVGLYSGLSA
20 30 40 50 60 70
7330 7300
5X_18- ILFKQVPYTMAKF
...: :: ..:
NR_SC: AVLRQCTYTTVRF
80
>>NR_SC:PIR-S58652 PIR:S58652 hypothetical protein YFR03 (216 aa)
rev-comp initn: 77 init1: 77 opt: 103 Z-score: 126.6 bits: 35.7 E(): 0.28
Smith-Waterman score: 103; 44.444% identity (44.444% ungapped) in 36 aa overlap (5677-5570:44-79)
5660 5630 5600
5X_18- TPSLPSSFHPSPLHSLSSSSSHPWHPHPCPSPPSLC
.::::. : : :. : :::: : : : :
NR_SC: SPSLPTRFTPCPVAVLPSSSSPSWSFSTSCMPESTC
50 60 70
>>NR_SC:SW-YKT9_YEAST SW:YKT9_YEAST P36045 saccharomyces (187 aa)
initn: 81 init1: 81 opt: 102 Z-score: 126.0 bits: 35.4 E(): 0.3
Smith-Waterman score: 102; 28.235% identity (28.571% ungapped) in 85 aa overlap (4862-5116:96-179)
4880 4910 4940 4970 5000 5030
5X_189 KSLTLLSLSPSSNLPSLATLPPPHPNFSPTPSSLRSSLRLTSNVLNRTPTACSTITSSST
.:.. .. :: . ::. ::: : . .:. .:: : : : .. .
NR_SC: RSMVDIAAHPSPTATVLASSPPPPPPATHVPAEALFTLRETPPPQLATLTLSEEPPATPA
100 110 120 130 140 150
5060 5090
5X_189 LFLPSLPYSSARGLKPAYRLPSRPS
:: : . .:: .: .:. . ::
NR_SC: PSAPSAPSARVRGHSP-HRVGASPS
160 170
>>NR_SC:SW-YAG3_YEAST SW:YAG3_YEAST P39712 saccharomyces (1322 aa)
initn: 71 init1: 71 opt: 109 Z-score: 124.8 bits: 38.0 E(): 0.35
Smith-Waterman score: 117; 27.612% identity (28.906% ungapped) in 134 aa overlap (892-1290:933-1061)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSS-SESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
.: : . : :: :. : .:: : ::.::. ..: .:. ....: :.:.:. :
NR_SC: ISSTTTSASILSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETGSASSASSSSSISSE-SPKSTYSSSS
940 950 960 970 980 990
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 LMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTP
: .. :. . ::.. .: . :::. : .:: ... .: .: .
NR_SC: LPPVTSATTS--QEITSSLPPVTTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESISSAIVSTATVT
1000 1010 1020 1030 1040
1270
5X_189 GAPGMAALEPWTCP
. . . : ::
NR_SC: VSGATTEYTTW-CP
1050 1060
>>NR_SC:PIR-S51959 PIR:S51959 hypothetical protein YAL06 (1367 aa)
initn: 71 init1: 71 opt: 109 Z-score: 124.6 bits: 38.0 E(): 0.36
Smith-Waterman score: 117; 27.612% identity (28.906% ungapped) in 134 aa overlap (892-1290:978-1106)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSS-SESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
.: : . : :: :. : .:: : ::.::. ..: .:. ....: :.:.:. :
NR_SC: ISSTTTSASILSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETGSASSASSSSSISSE-SPKSTYSSSS
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 LMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTP
: .. :. . ::.. .: . :::. : .:: ... .: .: .
NR_SC: LPPVTSATTS--QEITSSLPPVTTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESISSAIVSTATVT
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1270
5X_189 GAPGMAALEPWTCP
. . . : ::
NR_SC: VSGATTEYTTW-CP
1100
>>NR_SC:SW-Q12444 SW:Q12444 Q12444 saccharomyces cerevis (126 aa)
initn: 79 init1: 79 opt: 99 Z-score: 124.2 bits: 34.5 E(): 0.38
Smith-Waterman score: 99; 25.472% identity (25.962% ungapped) in 106 aa overlap (5480-5790:19-124)
5480 5510 5540 5570 5600 5630
5X_189 LRSKLRDLHLVRAARDCPAQSA*KWTSLTMTKRRRRRARMRVPRMRRRRGERVEGRRVER
.. : : . : :. . .: .: ::. : : : ::.: .: . : ..
NR_SC: MKRKKRKKRKKRRERETMMKIPRILKKLRRKRRTRRKRRKRRKRRRRKRRKRRRKRSPRK
20 30 40 50 60 70
5660 5690 5720 5750 5780
5X_189 RR*GESKRMFLVSYL-DL*LWLLF-FNSYLV/LVKCMILAWF*MVYN
:: ..: : . . : ::: : .. . ...:. : ....
NR_SC: RRKRRNKDAFYILIISDPSRSLLFGFRKFSI-IIQCLTYFSFHILFH
80 90 100 110 120
>>NR_SC:SW-TOA1_YEAST SW:TOA1_YEAST P32773 saccharomyces (286 aa)
rev-comp initn: 66 init1: 66 opt: 102 Z-score: 123.7 bits: 35.6 E(): 0.4
Smith-Waterman score: 124; 34.091% identity (47.619% ungapped) in 88 aa overlap (998-736:216-278)
990 960 930 900 870 840
5X_18- DVIDSDLDDSDDEFRGDVDGGEDENDVDIVFCVYDKVCCCLIIPLCG*LHMLIARFCGNR
: . :.::::::.. . .: :: : ....:.::::
NR_SC: DEVGSELDDSDDDYLIS-EGEEDGPDENLMLCLYDKV-----------------------
220 230 240 250
810 780 750
5X_18- S/TRVKNKWKTVFKDGMIHLNGKDYLFAK
::.: .:: .:::.. .: .:: : :
NR_SC: --TRTKARWKCSLKDGVVTINRNDYTFQK
260 270
>>NR_SC:SW-SIM1_YEAST SW:SIM1_YEAST P40472 saccharomyces (475 aa)
initn: 145 init1: 99 opt: 104 Z-score: 123.7 bits: 36.3 E(): 0.41
Smith-Waterman score: 120; 27.632% identity (30.216% ungapped) in 152 aa overlap (916-1359:109-251)
940 970 1000 1030 1060 1090
5X_189 STSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQ
:.. :.: ..: .::: .: :: . : .:. :: : . .:. :. : ::. .
NR_SC: SATASTSQGASSSSSSSSATSTLESSSVSSSSEEAAPTSTVVSTSSATQSSASSATKSST
110 120 130 140 150 160
1120 1150 1180 1210 1240 1270
5X_189 RGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPGAPGMAALE
. . :. . .::.: . : :. :.. :: ..
NR_SC: SSTSPSTSTSTSTSSTSSSSSSSSSSSSSSSGSGSIYGDLADFSGPSEK---------FQ
170 180 190 200 210
1300 1330
5X_189 PWTCPC----RGNGNISADWEFEGPAGGEEAS
: :: :.: :: :: :: .: : .
NR_SC: DGTIPCDKFPSGQGVISIDWIGEGGWSGVENT
220 230 240 250
>>NR_SC:GP-CAA47602_1 gi|4824|emb|CAA47602.1 (X67122) mi (307 aa)
rev-comp initn: 77 init1: 77 opt: 102 Z-score: 123.4 bits: 35.6 E(): 0.42
Smith-Waterman score: 102; 32.609% identity (32.609% ungapped) in 46 aa overlap (7433-7296:252-297)
7410 7380 7350 7320
5X_18- VSQPSFANGLSGGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFA
...:.:.:..:. . . : .::. :::: ... .: . : ::
NR_SC: LQKPKFGNSISSVAKTLYANGGIGAFFKGFGPTMLRAAPANGATFA
260 270 280 290
>>NR_SC:SW-YMC1_YEAST SW:YMC1_YEAST P32331 saccharomyces (307 aa)
rev-comp initn: 77 init1: 77 opt: 102 Z-score: 123.4 bits: 35.6 E(): 0.42
Smith-Waterman score: 102; 32.609% identity (32.609% ungapped) in 46 aa overlap (7433-7296:252-297)
7410 7380 7350 7320
5X_18- VSQPSFANGLSGGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFA
...:.:.:..:. . . : .::. :::: ... .: . : ::
NR_SC: LQKPKFGNSISSVAKTLYANGGIGAFFKGFGPTMLRAAPANGATFA
260 270 280 290
>>NR_SC:SW-YG5F_YEAST SW:YG5F_YEAST P53320 saccharomyces (366 aa)
rev-comp initn: 64 init1: 64 opt: 102 Z-score: 122.4 bits: 35.7 E(): 0.48
Smith-Waterman score: 103; 19.597% identity (21.935% ungapped) in 347 aa overlap (7944-6968:12-342)
7930 7900 7870 7840 7810
5X_18- IRRFALAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVYN-------RVGRFFNSS*GF*EL*
... :... : ..: :::.:::. :.: . . . .: .:. . ..
NR_SC: LKERMLSAGAGSVLTSLILTPMDVVRIRLQQQQMIPDCSCDGAAEVPNAVSSGSKMKTFT
20 30 40 50 60 70
7780 7750 7720 7690 7660 7630
5X_18- GVVLMSQTIGYGCLFPTNHC--QGGCRCSS\TGFGPTAVGY----AIQGAFKFGG*VMMS
.: .:... . .: . : . :. :: :. : .. ...: .. . ..
NR_SC: NV--GGQNLNNAKIFWESACFQELHCKNSS-LKFNGTLEAFTKIASVEGITSLWRGISLT
80 90 100 110 120
7600 7570 7540 7510 7480 7450
5X_18- LQITA*SRANLPISYEFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEAT
: .. . .::. . :. . .. . . .. :: ::. :: .. ::: .
NR_SC: LLMAIPANMVYFSGYEYIR----DVSPIASTYPTLNPLFCGA--IARVFAATSIAPLELV
130 140 150 160 170 180
7420 7390 7360 7330 7300
5X_18- RIRLVSQPS/SRQRSFRWFP*DFEGGRSRCLLRRFRPYPLQAGSLYHGQVRRVSRPY/WR
. .: : : : . . :. ...: .. : . .:..: . ::
NR_SC: KTKLQSIPR-SSKSTKTWMMVKDLLNETRQEMKMVGP----SRALFKG----LEITL-WR
190 200 210 220 230
7270 7240 7210 7180 7150 7120
5X_18- NNQTFG*YYRSYEVAVEKILKATGKSKDSLTGGQLTGLNLTSGLIAGLAAAVISQPAD--
. . :. :::. :.. . . .. .. ...:: :.:. ::. ..: :
NR_SC: DVPFSAIYWSSYELCKERLWLDSTRFASKDANWVHFINSFASGCISGMIAAICTHPFDVG
240 250 260 270 280 290
7090 7060 7030 7000 6970
5X_18- ------TLLSKINKTKGAPGQSTTSRLVQMAGQLGVSGLFTGMTTRLVMI
..... . : ... . : . :...:.::...:.. :
NR_SC: KTRWQISMMNNSDPKGGNRSRNMFKFLETIWRTEGLAALYTGLAARVIKI
300 310 320 330 340
>>NR_SC:SW-TIR3_YEAST SW:TIR3_YEAST P40552 saccharomyces (269 aa)
initn: 91 init1: 91 opt: 100 Z-score: 121.4 bits: 35.1 E(): 0.54
Smith-Waterman score: 100; 29.091% identity (29.358% ungapped) in 110 aa overlap (829-1158:112-220)
850 880 910 940 970 1000
5X_189 QKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPG
:. .::: . : ... . .. . :.: ::: :.: .::: .: : : .:: .
NR_SC: QSAGISITSLGQTVSESGSESATASSDASSASESSSAASSSASESSSAASSSASESSSAA
120 130 140 150 160 170
1030 1060 1090 1120 1150
5X_189 SKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGS
:. :. .:. ::: .: . :.: : . . .. .. .:..:
NR_SC: SSSASESSSAASSSA-SEAAKSSSSAKSSGSSAASSAASSASSKASSAAS
180 190 200 210 220
>>NR_SC:SW-Q08428 SW:Q08428 Q08428 saccharomyces cerevis (113 aa)
initn: 95 init1: 95 opt: 96 Z-score: 120.7 bits: 33.7 E(): 0.59
Smith-Waterman score: 121; 54.545% identity (60.000% ungapped) in 33 aa overlap (902-1000:31-60)
920 950 980
5X_189 HRKRYQRHFHPHHRRHHL*THHRSHLDRNR*RR
::.: .:: . :::::: ::: . : : ::
NR_SC: HRRRRRRHHRRHHRRHH---HHRRRRRRRRRRR
40 50 60
>>NR_SC:SW-FLO5_YEAST SW:FLO5_YEAST P38894 saccharomyces (1075 aa)
initn: 72 init1: 72 opt: 104 Z-score: 119.3 bits: 36.7 E(): 0.71
Smith-Waterman score: 121; 28.030% identity (31.624% ungapped) in 132 aa overlap (895-1290:707-823)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
: :...: :: :.: : : .:.: :: : ::.: ..:. .:.: : .. :
NR_SC: SSTSSVIPTSSSTSGSSESKTSSASSSSSSSSISSESPKSPTNSSSSLPPVTSATTG---
710 720 730 740 750 760
1090 1120 1150 1180 1210 1240
5X_189 SAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPGA
:.. . :: . .: . :::. : .:: ... .: .: . .
NR_SC: ----------QETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESISSAIVSTATVTVS
770 780 790 800 810
1270
5X_189 PGMAALEPWTCP
. : ::
NR_SC: GVTTEYTTW-CP
820
>>NR_SC:SW-YK82_YEAST SW:YK82_YEAST P36170 saccharomyces (1169 aa)
initn: 64 init1: 64 opt: 104 Z-score: 118.8 bits: 36.7 E(): 0.76
Smith-Waterman score: 104; 25.532% identity (26.471% ungapped) in 141 aa overlap (880-1290:839-978)
880 910 940 970 1000 1030
5X_189 QQHTLSYTQKTISTSF--SSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSA
.. . . :. ::..: ::: :: :.. .:..:: .:: . . .... :::.
NR_SC: HETSTASTSVQISSQFVTPSSPISTVAPRSTGLNSQTESTNSSKETMSSENSASVMPSSS
840 850 860 870 880 890
1060 1090 1120 1150 1180 1210
5X_189 YT--E*SLMSAS\EKSKEGRRNENTPLRLLTA*/PSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTN
: ... .... : :. :...: :. . . ::.. ::.. : ..:. ...
NR_SC: ATSPKTGKVTSD-ETSSGFSRDRTTVYRMTSET-PSTNEQTTLITVSSCESNSCSNTVSS
900 910 920 930 940 950
1240 1270
5X_189 PFVPSAPTPGAPGMAALEPWTCP
: .: : . : ::
NR_SC: AVVSTATTTINGITTEYTTW-CP
960 970
>>NR_SC:SW-YOD0_YEAST SW:YOD0_YEAST Q08193 saccharomyces (484 aa)
initn: 116 init1: 69 opt: 100 Z-score: 118.2 bits: 35.3 E(): 0.82
Smith-Waterman score: 100; 46.429% identity (48.148% ungapped) in 56 aa overlap (916-1083:405-458)
940 970 1000 1030 1060
5X_189 STSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS
:.: ::: :.: .:::::: : : .:: :.:.: ..: :.: . : .:.:
NR_SC: SSSSSSSSSSSSSASSSSESSSSTSKASS--SSPSASETSLLKSAASATSSSQSSS
410 420 430 440 450
>>NR_SC:SW-CW14_YEAST SW:CW14_YEAST O13547 saccharomyces (238 aa)
initn: 77 init1: 77 opt: 97 Z-score: 118.1 bits: 34.3 E(): 0.84
Smith-Waterman score: 97; 24.183% identity (24.667% ungapped) in 153 aa overlap (784-1234:53-205)
790 820 850 880 910 940
5X_189 EHRLPLVLYSLD-LFPQKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSS--PPSTSP
::. : :: . :.. : . . . . .:. .:. .... :.: ::: :..
NR_SC: EHENSAVKKCLDSICPNNDADAAYSAFKSSCSEQNASLGDSSSSASSSASSSSKASSSTK
60 70 80 90 100 110
970 1000 1030 1060 1090 1120
5X_189 LNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPL
.::: :: ... .:: .:. : .:. :::. . . :.: . . . :...
NR_SC: ASSSSASSSTKASSSSASSSTKASSSSAAPSSSKASSTESSSSSSSSTKAPSSEESSSTY
120 130 140 150 160 170
1150 1180 1210
5X_189 \TA*PRQGPSSL*FHPVVVHSALVPHR*QTHLCP
.. .:. :. : . :. : ... . :
NR_SC: -VSSSKQASSTSEAHSSSAASSTVSQETVSSALP
180 190 200
>>NR_SC:SW-TIR1_YEAST SW:TIR1_YEAST P10863 saccharomyces (254 aa)
rev-comp initn: 78 init1: 78 opt: 97 Z-score: 117.7 bits: 34.3 E(): 0.87
Smith-Waterman score: 97; 39.241% identity (41.892% ungapped) in 79 aa overlap (1483-1263:100-178)
1460 1430 1400 1370 1340
5X_18- SRLLTC*KTRNGKLSCSKHES----PT/SARAGSSSRSP-SPTLESKPEASSPPAGPSNS
::: :. :: : : : :: :. : ::: .: : . :. ::.: :.::.:
NR_SC: SRLEPALKSLNGDASSSAAPSSSAAPT-SSAAPSSSAAPTSSAASSSSEAKSSSAAPSSS
100 110 120 130 140 150
1310 1280
5X_18- QSADMFPFPRQGQVQGSSAA
.. . : ......::::
NR_SC: EAKSSSAAPSSSEAKSSSAA
160 170
>>NR_SC:SW-Q08873 SW:Q08873 Q08873 saccharomyces cerevis (200 aa)
initn: 85 init1: 85 opt: 95 Z-score: 116.3 bits: 33.7 E(): 1
Smith-Waterman score: 95; 31.868% identity (32.222% ungapped) in 91 aa overlap (7-275:63-153)
10 40 70 100 130 160
5X_189 LVNIIYGVKRGDVNTRYEVIPVLISIQI/DSIS-FLSPTRSYGCLFPSLYYFIDIMNVSA
:.::.: . :..: . .:. :.:: ::: .:.:: :. ::... .
NR_SC: LANILYEADTGEANHISWKSSKMPFVQM-DQISQFLSFSRKYGVPEDELFQTIDLFEKKD
70 80 90 100 110 120
190 220 250
5X_189 LFT*T*MLSELSVQLSKVHCDEFPNES*EIST
:. :: .: : :.:: . ..::
NR_SC: PAIVFQTLKSLSRYANKKHTDRFPVLGPQLST
130 140 150
>>NR_SC:SW-TIR2_YEAST SW:TIR2_YEAST P33890 saccharomyces (251 aa)
initn: 92 init1: 92 opt: 95 Z-score: 115.1 bits: 33.8 E(): 1.2
Smith-Waterman score: 95; 33.846% identity (33.846% ungapped) in 65 aa overlap (889-1083:120-184)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
: . . : :. ::: ..: . ::::.. : .:: .:. :: .:.. :: : .
NR_SC: TEASSAATSSAVASSSETTSSAVASSSEATSSAVASSSEASSSAATSSAVASSSEATSST
120 130 140 150 160 170
5X_189 LMSAS
. :..
NR_SC: VASST
180
>>NR_SC:SW-CBF5_YEAST SW:CBF5_YEAST P33322 saccharomyces (483 aa)
initn: 77 init1: 77 opt: 97 Z-score: 114.2 bits: 34.6 E(): 1.4
Smith-Waterman score: 97; 20.635% identity (21.757% ungapped) in 252 aa overlap (4951-5685:225-470)
4960 4990 5020 5050 5080 5110
5X_189 TELSSLLTPFDIKRLESYADSMLDYHVVLDLVPTIASLFFGKRLETSLPPAQQAI-----
.: ....: :. . :. : . ... . .:. : . . : .:.
NR_SC: SENDNMVTLHDVMDAQWVYDNTRDESYLRSIIQPLETLLVGYKRIVVKDSAVNAVCYGAK
230 240 250 260 270 280
5140 5170 5200 5230 5260
5X_189 LLALGLQR--KNVEALENELGITSTQTLALFGKVLRKMTKSLEDIRKASIAS/VTSC*AD
:. :: : ...: : .:. . .:. :. . . : .: . .. .:: : : .
NR_SC: LMIPGLLRYEEGIE-LYDEIVLITTKGEAIAVAIAQMSTVDLASCDHGVVAS-VKRCIME
290 300 310 320 330 340
5290 5320 5350 5380 5410 5440
5X_189 PRRPISQRV*QVC\PLQQTIEQDLADSAVQLNGEDDDASKKEQRELLNTLNMEEFAIDQG
: . : . :. : .: ::. .. :. .. . .. .. :. : . ...
NR_SC: --RDLYPRRWGLG-PVAQKKKQMKADGKLDKYGRVNENTPEQWKKEYVPLDNAEQSTSSS
350 360 370 380 390
5470 5500 5530 5560 5590 5620
5X_189 GDWTEAEKQVERLASGKGGTRLSSTVSVKVDKLDDDKAKAEKGKDAGAKDAKKKRRESGG
. :.:.. .. .: . .. . . : . .::. : .: : . .::....
NR_SC: QETKETEEEPKK---AKEDSLIKEVETEKEEVKEDDSKKEKKEKKDKKEKKEKKEKKDKK
400 410 420 430 440 450
5650 5680
5X_189 EKGGKKKVRRE*ED
:: ::. .:. ::
NR_SC: EKKEKKEKKRKSED
460 470
>>NR_SC:SW-KRE1_YEAST SW:KRE1_YEAST P17260 saccharomyces (313 aa)
initn: 88 init1: 88 opt: 95 Z-score: 113.9 bits: 33.9 E(): 1.4
Smith-Waterman score: 95; 39.655% identity (40.351% ungapped) in 58 aa overlap (889-1062:139-195)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE
: ..:... :.. ::. :.: ::: :: : . :.: :: : :. ::. .::
NR_SC: TQTFTHSSTSAT-SSASSSVSSSVSSSGSSSSVKTTTSTGSAVAETGTRPDPSTDFTE
140 150 160 170 180 190
>>NR_SC:GP-CAA52447_1 gi|396560|emb|CAA52447.1 (X74428) (250 aa)
initn: 91 init1: 91 opt: 94 Z-score: 113.8 bits: 33.6 E(): 1.4
Smith-Waterman score: 94; 33.846% identity (33.846% ungapped) in 65 aa overlap (889-1083:119-183)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
: . . : :. ::: ..: . ::::.. : .:: .:. :: .:.. :: : .
NR_SC: TEASSAATSSAVASSSETTSSAVASSSEATSSAVASSSEASSSAATSSAVASSSEATSSA
120 130 140 150 160 170
5X_189 LMSAS
. :..
NR_SC: VASST
180
>>NR_SC:GP-CAA81388_1 gi|439289|emb|CAA81388.1 (Z26645) (751 aa)
initn: 76 init1: 76 opt: 98 Z-score: 113.2 bits: 35.0 E(): 1.6
Smith-Waterman score: 105; 23.759% identity (24.723% ungapped) in 282 aa overlap (3283-4117:140-414)
3310 3340 3370 3400 3430
5X_189 LTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTS\PRSPTNHPIHLP
:.: . . :: : .: . :. . ..:. : :... :. : :.: :.:
NR_SC: LSPAPAVPSIPSSSAPPIPDIPSSAAPPIPIVPSSPAPPLPLSGASA-PKVPQNRP-HMP
140 150 160 170 180 190
3460 3490 3520 3550 3580 3610
5X_189 RRFSRSRPS*/RLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISC----LWPPPSTVTRVLA/DSLSIK
: : :: ..:: : . ..: : ::: . . :: .::
NR_SC: SVRPAHRSHQ-RKSSNISLPSVSAPPLPSASLPTHVSNPPQAPPPPPTPTIGL-DSKNIK
200 210 220 230 240 250
3640 3670 3700 3730 3760 3790
5X_189 \PFSNSVNRHDHRLPRIARMRLPALLVHLPR\RGCW*IGRWSRAISS*DQA**AYPLLPR
: .:.:. . ..: . : . .. . :: .. . .. ::
NR_SC: -PTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAEINARRSE-RGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQRPLPSS
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3820 3850 3880 3910 3940 3970
5X_189 RQC*KVVEQPPLP/PMPPSSPNLSKVALTLPNASFTMSTATLSSLITPLQKCSCKG*WRS
. . :::: : : :.: .:. . :. . . : . ... : .. .
NR_SC: APPIPTSHAPPLP-PTAPPPPSLPNVT-SAPKKATSAPRPPPPPLPAAMSSASTNSVKAT
320 330 340 350 360 370
4000 4030 4060 4090
5X_189 TSLPTTRTLLTTCRCFP\SSRSSSFRSPPPYRRE**YPP*PSCRPSSRA
:: : . : ...::. .::: :: :. .: :
NR_SC: PVPPTLAPPLPNTTSVP-PNKASSMPAPPP-----PPPPPPGAFSTSSA
380 390 400 410
>>NR_SC:SW-VRP1_YEAST SW:VRP1_YEAST P37370 saccharomyces (817 aa)
initn: 76 init1: 76 opt: 98 Z-score: 112.7 bits: 35.1 E(): 1.7
Smith-Waterman score: 110; 25.088% identity (26.296% ungapped) in 283 aa overlap (3283-4117:140-414)
3310 3340 3370 3400 3430
5X_189 LTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTS\PRSPTNHPIHLP
:.: . . :: : .: . :. . ..:. : :... :. : :.: :.:
NR_SC: LSPAPAVPSIPSSSAPPIPDIPSSAAPPIPIVPSSPAPPLPLSGASA-PKVPQNRP-HMP
140 150 160 170 180 190
3460 3490 3520 3550 3580 3610
5X_189 RRFSRSRPS*/RLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISC----LWPPPSTVTRVLA/DSLSIK
: : :: ..:: : . ..: : ::: . . :: .::
NR_SC: SVRPAHRSHQ-RKSSNISLPSVSAPPLPSASLPTHVSNPPQAPPPPPTPTIGL-DSKNIK
200 210 220 230 240 250
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5X_189 \PFSNSVNRHDHRLPRIARMRLPALLVHLPR\RGCW*IGRWSRAISS*DQA**AYPLLPR
: .:.:. . ..: . : . .. . :: : : :.. .. . : ::
NR_SC: -PTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAEINARRSE-RGAVE-GVSSTKIQTENHKSPSQPPLPS
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5X_189 R-QC*KVVEQPPLP/PMPPSSPNLSKVALTLPNASFTMSTATLSSLITPLQKCSCKG*WR
. . :::: : : :.: .:. . :. . . . : . ... : ..
NR_SC: SAPPIPTSHAPPLP-PTAPPPPSLPNVT-SAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKA
320 330 340 350 360 370
3970 4000 4030 4060 4090
5X_189 STSLPTTRTLLTTCRCFP\SSRSSSFRSPPPYRRE**YPP*PSCRPSSRA
. :: : . : ...::. .::: :: :. .: :
NR_SC: TPVPPTLAPPLPNTTSVP-PNKASSMPAPPP-----PPPPPPGAFSTSSA
380 390 400 410
>>NR_SC:SW-Q07229 SW:Q07229 Q07229 saccharomyces cerevis (817 aa)
initn: 76 init1: 76 opt: 98 Z-score: 112.7 bits: 35.1 E(): 1.7
Smith-Waterman score: 102; 24.735% identity (25.926% ungapped) in 283 aa overlap (3283-4117:140-414)
3310 3340 3370 3400 3430
5X_189 LTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTS\PRSPTNHPIHLP
:.: . . :: : .: . . . ..:. : :... :. : :.: :.:
NR_SC: LSPAPAVPSIPSSSAPPIPDIPSFAAPPIPIVPSSPAPPLPLSGASA-PKVPQNRP-HMP
140 150 160 170 180 190
3460 3490 3520 3550 3580 3610
5X_189 RRFSRSRPS*/RLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISC----LWPPPSTVTRVLA/DSLSIK
: : :: ..:: : . ..: : ::: . . :: .::
NR_SC: SVRPAHRSHQ-RKSSNISLPSVSAPPLPSASLPTHVSNPPQAPPPPPTPTIGL-DSKNIK
200 210 220 230 240 250
3640 3670 3700 3730 3760 3790
5X_189 \PFSNSVNRHDHRLPRIARMRLPALLVHLPR\RGCW*IGRWSRAISS*DQA**AYPLLPR
: .:.:. . ..: . : . .. . :: : : :.. .. . : ::
NR_SC: -PTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAEINARRSE-RGAVE-GVSSTKIQTENHKSPSQPPLPS
260 270 280 290 300 310
3820 3850 3880 3910 3940
5X_189 R-QC*KVVEQPPLP/PMPPSSPNLSKVALTLPNASFTMSTATLSSLITPLQKCSCKG*WR
. . :::: : : :.: .:. . :. . . . : . ... : ..
NR_SC: SAPPIPTSHAPPLP-PTAPPPPSLPNVT-SAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKA
320 330 340 350 360 370
3970 4000 4030 4060 4090
5X_189 STSLPTTRTLLTTCRCFP\SSRSSSFRSPPPYRRE**YPP*PSCRPSSRA
. :: : . : ...::. .::: :: :. .: :
NR_SC: TPVPPTLAPPLPNTTSVP-PNKASSMPAPPP-----PPPPPPGAFSTSSA
380 390 400 410
>>NR_SC:SW-Q12218 SW:Q12218 Q12218 saccharomyces cerevis (487 aa)
initn: 63 init1: 63 opt: 94 Z-score: 110.2 bits: 33.9 E(): 2.3
Smith-Waterman score: 97; 27.778% identity (28.302% ungapped) in 108 aa overlap (775-1092:87-194)
790 820 850 880 910 940
5X_189 SVFEHRLPLV-LYSLDLFPQKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSSPPSTS
:. :: : .: :: :.:. .:.. . . . .. .. .. . ::: : .: :.
NR_SC: SAVEHMLTMVPWYSSRLLPELEAMDASLTTSSSAATSSSEVASSSIASSTSSSVAPSSSE
90 100 110 120 130 140
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5X_189 PLNSSSESSRSESITSS-PGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KE
..:: : :: ..:: :. . .:.. ::. . : .. : .:
NR_SC: VVSSSVAPSSSEVVSSSVAPSSSEVVSSSVASSSSEVASSSVAPSSSE
150 160 170 180 190
>>NR_SC:GP-AAA35091_1 gi|295671|gb|AAA35091.1 (L11275) s (406 aa)
initn: 78 init1: 78 opt: 92 Z-score: 108.5 bits: 33.3 E(): 2.8
Smith-Waterman score: 109; 30.682% identity (30.682% ungapped) in 88 aa overlap (895-1158:26-113)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
: .... :.: ::: :.: .::.::: : : .:: .:. .. .: ::. . :
NR_SC: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGESSSSSSSSSSSSSSDSSDSSDSESSSSSSSSSSS
30 40 50 60 70 80
1090 1120 1150
5X_189 SAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGS
:.: ..... .. . .. . .::.:
NR_SC: SSSSSDSESSSESDSSSSGSSSSSSSSS
90 100 110
>>NR_SC:SW-SR40_YEAST SW:SR40_YEAST P32583 saccharomyces (406 aa)
initn: 78 init1: 78 opt: 92 Z-score: 108.5 bits: 33.3 E(): 2.8
Smith-Waterman score: 109; 30.682% identity (30.682% ungapped) in 88 aa overlap (895-1158:26-113)
910 940 970 1000 1030 1060
5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
: .... :.: ::: :.: .::.::: : : .:: .:. .. .: ::. . :
NR_SC: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGESSSSSSSSSSSSSSDSSDSSDSESSSSSSSSSSS
30 40 50 60 70 80
1090 1120 1150
5X_189 SAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGS
:.: ..... .. . .. . .::.:
NR_SC: SSSSSDSESSSESDSSSSGSSSSSSSSS
90 100 110
>>NR_SC:SW-TIP1_YEAST SW:TIP1_YEAST P27654 saccharomyces (210 aa)
initn: 77 init1: 77 opt: 89 Z-score: 108.1 bits: 32.3 E(): 3
Smith-Waterman score: 89; 35.000% identity (35.593% ungapped) in 60 aa overlap (913-1089:104-163)
940 970 1000 1030 1060
5X_189 ISTSFSSSPPSTSPLNSSSE-SSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*K
:.....: :..: :::: .: :.. .:: ... :: .:. :::. . : .: :
NR_SC: IAAALASVSPASSEAASSSEAASSSKAASSSEATSSAAPSSSAAPSSSAAPSSSAESSSK
110 120 130 140 150 160
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.. .:. : .: . .: :.. ..:. ::..: ::. . .: . . :: :::
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. . : :: . ::: .: :: :
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5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSS
: . .:...: :::: :.: .::. :: : ::..:
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: : : : . .:.. :. :.: ::: :.. .::. :: : : .:: .
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:. .. :. ..: : . :.: .:. ..
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:..:: . :. . .:. :: : : :. : :: : .::.. ..:..
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.::.:. .::. . .:.. . ::: .: : .:::. .. :. :. : ..
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. .:. . :.:: . . :.. : .. ... :: .. :: .:. .:
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:.:. :.. .:. : : . . .. :: ... ... ::..::: . . :
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. .: . :: : :: : : . ... ....::. . :: :..:. . . :..:.:
NR_SC: S-SSSSSSS-SSSSSSSSSSSSSSSYFTLSTSSSSSIYSSSSYPSFSSSSSSNPTSSITS
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5X_189 STATLSSLITPLQKCS
..: :: ::: .. :
NR_SC: TSA--SSSITPASEYS
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::. ::: : .: .:..::: . : : .:. .. . . .: :. :: : . . . .
NR_SC: STTESSSAPVPTPSSSTTESSVAPVPTPSSSSNITSSAPSSTPFSSSTESSSVPVPTPSS
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. .: .. :.. :. .:. . .: : . : . ::
NR_SC: ---STTESSSAPVSSSTTESSVAPVPTPSSSSNITSSAPSSIPF
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>>NR_SC:SW-HRB1_YEAST SW:HRB1_YEAST P38922 saccharomyces (429 aa)
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5X_189 ER*RRRPNQR*DRK*G
. : : : : : . :
NR_SC: RSFRSRHNTRDDSRRG
90 100
>>NR_SC:SW-MID2_YEAST SW:MID2_YEAST P36027 saccharomyces (376 aa)
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. .::: : : :: .: :. : ::. :.. .: :...:: ....:::.:.
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:..... .. . : :: . :.. .. .. ..:: : :.:. : .
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NR_SC: PSTTAYNQGSTITSII
180
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Function used was FASTXY [version 3.4t07 Nov 21, 2001]