HMMER2.0 [2.2g]
NAME Ribosomal_S11
ACC PF00411
DESC Ribosomal protein S11
LENG 124
ALPH Amino
RF no
CS no
MAP yes
COM hmmbuild -F HMM_ls.ann SEED.ann
COM hmmcalibrate --seed 0 HMM_ls.ann
NSEQ 13
DATE Mon May 27 08:06:43 2002
CKSUM 237
GA -4.0 -4.0
TC 11.6 11.6
NC -21.0 -21.0
XT -8455 -4 -1000 -1000 -8455 -4 -8455 -4
NULT -4 -8455
NULE 595 -1558 85 338 -294 453 -1158 197 249 902 -1085 -142 -21 -313 45 531 201 384 -1998 -644
EVD -108.950523 0.190494
HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
m->m m->i m->d i->m i->i d->m d->d b->m m->e
-138 * -3458
1 -1728 2165 -3912 -4206 -4772 3371 -3936 -4658 -4377 -4894 -3991 1459 -3355 -3952 -4242 -1970 -2189 -3474 -4930 -4812 1
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 -138 *
2 -2058 -1892 -3752 -3230 -2150 -3689 -2646 2788 858 -1606 -1191 529 -3715 -2725 -2726 -2830 -2019 2149 -2858 -2468 2
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
3 1941 -1464 -3256 -2683 -1556 -3032 -1974 1785 797 -1293 -722 -2476 -3107 -2181 -2447 -2114 412 1377 -2106 -1735 3
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
4 -3887 -3917 -4274 -3473 -1005 -4354 4621 -3966 -1436 -3492 -3218 -3081 -4324 -2223 1964 -3717 -3650 -3924 -1603 2103 4
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
5 -2738 -2294 -5285 -4896 -2431 -4934 -4121 3324 -4717 -1647 -1527 -4556 -4772 -4485 -4710 -4202 -2718 1801 -3631 1753 5
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
6 -1649 -2785 -1664 -1040 614 -2593 2342 -2743 812 -2709 -1907 -1267 -2655 2839 595 -1568 -1555 -2421 -2576 2271 6
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
7 2522 -1942 -3765 -3499 -3217 -2439 -2978 -2792 -3273 389 -2383 -2749 -3078 -3003 -3308 1578 1236 -2323 -3594 -3292 7
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
8 -1581 -2112 -4051 -4031 1555 -2511 -3263 -3397 -3852 -3653 -2947 -2990 -3224 -3498 -3769 2748 2342 -2766 -3628 -3002 8
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- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
9 -3658 -3257 -4651 -4518 4020 -4582 -1624 -2975 -4120 -2766 -2527 -3557 -4575 849 -3899 -3761 375 -2990 -974 1796 9
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -2296 -8467 -334 -894 -1115 -701 -1378 * *
10 -1 -610 -1022 -1072 -1936 -782 -1141 -1840 -1134 -2103 -1418 -788 -1430 -1029 -1298 2934 -350 -1213 -2165 -1721 10
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -29 -6200 -7243 -894 -1115 -3362 -148 * *
11 -1217 -1849 -998 -627 -2373 -1676 -406 -2090 3246 -2047 -1443 -719 -1903 -70 500 -1190 -1156 -1833 -1956 -1704 11
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -29 -6200 -7243 -894 -1115 -3362 -148 * *
12 -1217 -1849 -998 -627 -2373 -1676 -406 -2090 3246 -2047 -1443 -719 -1903 -70 500 -1190 -1156 -1833 -1956 -1704 12
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -29 -6200 -7243 -894 -1115 -3362 -148 * *
13 -1407 -1801 -1677 -1131 -2297 -1809 -624 -2199 412 -2093 -1559 -1109 -2052 -336 3574 -1451 -1369 -1967 -1918 -1738 13
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -29 -6200 -7243 -894 -1115 -91 -4039 * *
14 -2875 -3503 -2573 -2948 -5302 265 -3692 -5559 -4049 -5546 -4860 4230 -3972 -3578 -4373 -2983 -3254 -4566 -5083 -4927 14
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
15 -3236 -4795 891 -1351 -5268 -3023 -2584 -5467 -3025 -5299 -4766 4157 -3626 -2310 -3950 -2917 -3388 -4852 -5209 -4322 15
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
16 -1930 -2282 -4651 -4736 -3672 -2958 -4084 -1491 -4445 -2985 -2685 -3547 -3646 -4171 -4281 -2336 3552 1733 -4475 -4177 16
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
17 -3729 -3186 -6108 -5588 2198 -5807 -4358 3191 -5367 1199 -505 -5439 -5110 -4350 -4962 -5113 -3612 -1305 -3209 -3012 17
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
18 -2958 -2447 -5625 -5283 -2819 -5450 -5291 2926 -5228 551 -1537 -5107 -5143 -5046 -5323 -4815 -2941 2529 -4548 -4161 18
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
19 -74 -2159 -3306 -3205 -4035 -2418 1687 -3766 -3139 -3992 -3145 -2648 -3108 -2947 -3283 431 3550 -2952 -4257 -3941 19
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
20 -2968 -2457 -5631 -5284 -2778 -5450 -5259 2820 -5223 792 -1500 -5108 -5137 -5018 -5304 -4812 -2949 2551 -4501 -4135 20
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
21 -1605 -2215 -4211 -4508 -4728 -2475 -3983 -4551 -4439 -4828 -3917 -3156 -3274 -4024 -4223 453 3832 -3354 -4943 -4822 21
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
22 -5158 -5086 4195 -3632 -6167 -4446 -4452 -6919 -5060 -6509 -6265 -3965 -4969 -4469 -5423 -5050 -5327 -6447 -5289 -5750 22
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
23 -1228 -1103 -3281 -2663 -1060 -2742 -1596 1476 -2310 725 -300 -2288 1101 670 100 -1814 -1169 1695 -1556 1054 23
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- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
24 -1080 -2547 -930 607 -2867 -2054 1249 597 1139 -2562 -1637 731 -2147 1456 835 222 1108 -2169 -2731 -2051 24
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
25 -5009 -4658 -5599 -5975 -6339 3844 -5470 -7140 -6257 -6747 -6464 -5673 -5235 -6046 -5830 -5318 -5379 -6405 -5297 -6309 25
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
26 897 -3236 -1870 -1394 -3856 -2842 -1400 -3471 -500 -3332 -2527 2753 -2988 580 2635 -1995 -2016 -3080 -3376 -2935 26
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
27 759 -1959 -2274 1655 -2457 -2598 -1961 -1439 -1935 -2196 -1554 -1969 -2927 -1789 -2251 -1762 1287 2457 -2863 -2428 27
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
28 -1318 -1209 -3233 -2625 -1189 -2831 -1684 1707 143 538 -407 -2321 -2879 671 -2246 -1900 1203 1921 -1699 -1344 28
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- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
29 827 -1067 -3476 -2848 1493 -333 -1631 678 -2464 742 -270 -2378 -2814 -2105 -2298 782 445 1031 -1525 -1181 29
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
30 206 -1342 -3528 -2970 900 -2803 -1792 -924 -2625 -1269 -639 -2492 -2966 -2285 -2515 1232 -1398 524 4910 -1181 30
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- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
31 612 -2561 -1074 -513 -2877 -2155 -793 -2595 1305 -2565 -1667 -807 -2245 1476 621 1910 -1117 -30 -2747 -2106 31
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
32 357 -2030 -4113 -3997 -3737 -2442 -3400 414 -3760 -3638 -2879 -2951 -3156 -3434 -3704 3225 370 -2563 -4095 -3848 32
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
33 2830 -2124 -4540 -4748 -4710 -2406 -3998 -4494 -4518 -4763 -3819 -3155 -3208 -4040 -4266 2137 592 -3273 -4937 -4860 33
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- -6 -8467 -9509 -894 -1115 -701 -1378 * *
34 -5009 -4658 -5599 -5975 -6339 3844 -5470 -7140 -6257 -6747 -6464 -5673 -5235 -6046 -5830 -5318 -5379 -6405 -5297 -6309 34
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
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35 1007 -2125 -4409 -4520 -4677 2086 -3892 -4473 -4322 -4720 -3773 -3097 -3192 -3887 -4155 2143 1730 -3263 -4892 -4787 35
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105 -2568 -2267 -5165 -4879 -2908 660 -4505 3508 -4725 -1873 -1725 -4420 -4585 -4556 -4742 -3775 -2634 1234 -4234 -3789 105
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108 -3621 -3363 -5522 -5627 -4058 -4560 -5131 -1437 -5562 -3183 -3128 -5132 -4975 -5432 -5386 -4498 -3804 3840 -4837 -4707 108
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